针对您提出的“案件已归档逾期的怎么处理”这一问题，我会结合相关实践经验和法律规定，为您提供一个清晰、详细且有深度的解答。

首先，我们需要明确的是，案件归档逾期通常指的是在案件结案后，相关卷宗材料未能在规定的时间内完成整理、装订和归档工作。这种情况可能会影响到卷宗的安全性和后续查阅的便利性，甚至可能增加卷宗遗失的风险。

针对这一问题，处理方式通常包括以下几个步骤：

1. 清查底数，明确责任：

   • 法院或相关机构应首先对历年遗留的未归档老案卷宗进行全面清查，摸清底数。
   • 成立由分管领导任组长的领导小组，制订细化实施方案和工作推进时间表。
   • 明确未归档案卷的责任部门和责任人，逐一交办至相关部门和每个未归档案件承办人，限期做好缺补重建和整理归档工作。

2. 能力提升与培训：

   • 为提高干警的卷宗归档业务能力，可以组织经验丰富、专业素养高的书记员进行授课。
   • 针对卷宗的整理、装订、归档等各个环节展开详细且全面的讲解，并选取真实卷宗演示操作。
   • 建立一对一的帮扶机制，由业务骨干对新入职书记员进行指导，确保他们能够尽快熟悉和掌握卷宗归档工作。

3. 明确责任与提升效率：

   • 制定并完善档案综合管理规定，对工作责任进行细致划分，明确法官、书记员在案件归档中的工作职责。
   • 书记员负责收集、整理、立卷，承办法官负责检查归档案卷质量，并在各个环节做好节点时间信息的记录。
   • 逐步建立起已结案件纸质卷宗和电子卷宗规范、及时、有序归档的常态化、科学化机制。

4. 监督有力与保障质量：

   • 建立限期归档制度，明确要求各业务庭在一定时间内首次提交归档，并在规定时间内必须实现归档。
   • 档案室严格按照归档要求检查归档文件，对不符合归档要求的提出意见后退回业务部门重新整理并限期归档。
   • 对不按时或者多次不按要求归档的，档案室将对该团队进行全院通报，以确保归档工作的顺利进行。

5. 特殊情况处理：

   • 如果是因为特殊原因（如系统故障、人员变动等）导致归档逾期，应及时向相关部门说明情况，并尽快采取补救措施。
   • 对于无正当理由逾期归档的，应依法依规追究相关人员的责任，以确保归档工作的严肃性和规范性。

在实际操作中，不同机构或法院可能会根据具体情况制定更为详细或略有差异的处理流程。但总体来说，处理案件归档逾期问题的核心在于明确责任、提升能力、加强监督和确保质量。希望这些建议能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。