员工将企业车辆卖了并将钱款进入公司账户，这一行为是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 若员工有合法授权或职务行为：

   • 如果员工是经过公司明确授权，比如作为公司的采购或销售负责人，在职责范围内处理公司资产，包括车辆的处置，并且这种处置行为符合公司的规章制度和内部流程，同时钱款也按照公司规定进入了公司账户，那么这种行为是合法的。
   • 法律依据：根据《公司法》及相关公司管理制度，员工在职务范围内代表公司行事，其法律后果由公司承担。

2. 若员工无合法授权或超出职务范围：

   • 如果员工未经公司授权，私自将公司车辆出售，并将所得款项进入公司账户，即使钱款最终进入了公司账户，这一行为仍然可能构成违法。因为员工没有处置公司资产的合法权限，其擅自出售车辆的行为可能侵犯了公司的财产权。
   • 可能构成的违法情形：
     • 职务侵占罪：如果员工利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有（尽管在此案例中钱款进入了公司账户，但出售行为本身未经授权），数额较大的，可能构成职务侵占罪。不过，由于钱款最终进入了公司账户，这一罪名的成立可能存在争议，需要具体分析。
     • 盗窃罪或其他财产犯罪：如果员工的行为被认定为秘密窃取公司财物（尽管车辆是通过出售方式处置，但出售行为本身非法），则可能构成盗窃罪或其他相关财产犯罪。然而，这种情况较为罕见，因为出售行为通常不是秘密进行的。
     • 民事侵权：无论是否构成犯罪，员工未经授权出售公司车辆的行为都可能构成对公司的民事侵权，公司有权要求员工赔偿因此造成的损失。
   • 法律建议：公司应立即对此事进行调查，明确员工的授权情况和出售车辆的具体经过。如果员工确实未经授权，公司应考虑采取法律措施维护自身权益，包括但不限于要求员工返还车辆或赔偿损失，以及向公安机关报案。

总结与建议：

• 员工将企业车辆卖了并将钱款进入公司账户的行为是否违法，取决于员工是否有合法授权或是否在职务范围内行事。
• 如果员工有合法授权且行为符合公司规定，则行为合法。
• 如果员工无合法授权或超出职务范围，则行为可能违法，公司应采取相应法律措施维护自身权益。
• 建议公司加强内部管理，明确员工职责和权限，防止类似事件再次发生。同时，如果公司遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。