工程款债权中的农民工工资，在符合一定条件下是可以转让的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律层面分析
工资债权的可转让性：
- 工资债权，包括农民工工资债权，通常被视为普通债权。按照债权转让的一般规则，只要存在合法有效的债权，且该债权具备可转让性（即法律法规未禁止其转让），就可以进行转让。
- 农民工工资债权大多符合这些要求，因此，在法律层面，农民工工资债权具有可转让性。
禁止转让的例外情况：
- 尽管工资债权本身具有可转让性，但在实际操作中，特别是工程建设领域，存在禁止将农民工工资支付行为转让、转包的规定。这些规定的目的在于保障农民工工资能直接发放到手，避免因中间环节过多而出现工资发放受阻的情况。
- 然而，需要明确的是，禁止工资支付行为转让，并不代表工资债权本身不能转让。如果只是农民工将基于工资产生的对用人单位的债权进行转让，并在通知债务人之后，这种转让一般是有效的。
二、实际操作中的注意事项
通知债务人：
- 债权转让必须通知债务人，否则对债务人不发生效力。这是债权转让的基本程序要求，也是保障债务人知情权的重要体现。
- 在农民工工资债权转让的情况下，农民工或受让人必须及时通知用人单位（债务人），以确保转让行为的合法性。
保障农民工权益：
- 在实际操作中，为保障农民工权益，转让时要谨慎。要确保受让人（如第三方追讨公司）有足够能力且遵循相关规定追讨工资，避免出现损害农民工利益的情况。
- 如果转让行为可能影响农民工权益的实现或违背保护初衷，那么这种转让可能受到限制。
三、具体案例分析
- 假设某建筑公司拖欠农民工工资，农民工打算将这笔工资债权转让给第三方追讨公司以讨回工资。在这种情况下，只要农民工与第三方追讨公司达成转让协议，并通知建筑公司，且该债权不属于依性质或法律规定不得转让的类型，那么转让行为就是有效的。
- 然而，如果建筑公司以工程建设领域禁止工资支付行为转让为由进行抗辩，那么需要明确的是，这种抗辩并不针对工资债权本身的转让，而是针对工资支付行为的转让。因此，在农民工单纯转让基于工资产生的对建筑公司的债权的情况下，建筑公司的抗辩理由是不成立的。
建议：在涉及农民工工资债权转让时，务必遵循相关法律法规和程序要求，确保转让行为的合法性和有效性。同时，要充分考虑农民工的权益保护问题，避免因转让行为而损害其合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。