针对您提出的“盖了章的工程资料如何作废”的问题，这是一个涉及文件管理和法律合规性的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确盖章文件的属性与应用领域。工程资料作为项目管理和法律合规性的重要依据，其作废过程必须严谨且符合相关法律法规。
一、一般作废流程
标注作废：
- 对于篇幅较长的工程资料，如报告、图纸等，建议在每页的显著位置单独标注“作废”字样，并签上您的名讳和具体日期。这样做可以确保每一页都被明确标识为无效文件。
- 如果工程资料只有一张纸或几页纸，且公章位置较为集中，您可以通过画斜线或其他方式破坏公章的整体性，并在旁边标记为“作废”，同时署上您的名字和日期。
内部记录与通知：
- 作废工程资料后，应在公司内部进行记录，包括作废的文件名称、编号、作废日期以及作废原因等。
- 如果该工程资料涉及其他部门或外部单位，应及时通知相关方，确保他们了解文件已作废，避免误用。
二、特殊情况处理
法律依据或流程中的文件：
- 如果工程资料已成为法律依据或正在某特定流程中发挥作用（如合同、审批文件等），废止文件必须遵守相关法律法规和程序。
- 在这种情况下，可能需要发表正式声明或发送公告，甚至通过法律手段提出申请予以取消。具体流程应咨询法律专业人士或相关部门。
档案保存要求：
- 考量这份工程资料是否有档案保存要求。即使文件已作废，仍应依照规定进行妥善处置，如归档保存或销毁（需符合档案销毁规定）。
三、双方盖章文件的作废
如果工程资料是双方盖章的文件（如合同、协议等），作废过程需要更加谨慎：
协商废止：
- 若废止决定系经双方充分协商达成共识后作出，则需要签署一份详尽无遗且清晰无误的废止协议。该协议应明确表示原文件自此以后将不再具备任何法律约束力。
法律途径：
- 倘若由于其中一方存在欺诈行为或者受到胁迫而导致合同存在可撤销的情形，那么必须通过法律途径寻求解决方案。向法院或者仲裁机构提出撤销请求，并等待相关机构做出公正合理的裁决。
四、证据保存与义务处理
- 在实际操作过程中，应特别关注并妥善保存相关的证据材料，如双方之间的往来电子邮件、即时通讯记录等，以便能够有力地证明废止的具体原因以及整个过程。
- 针对那些已经根据该文件履行了部分义务的情况，也需要认真处理好相关的权利与义务关系，以防止新的纠纷产生。
综上所述，盖了章的工程资料作废过程需要严谨且符合相关法律法规。建议您在作废前咨询法律专业人士或相关部门，以确保作废过程的合法性和有效性。