银行逾期罚息通常不是一次性扣除，而是按日或按月持续计算并收取，具体取决于贷款合同约定及银行规定。以下从不同角度展开分析：

1. 合同约定优先
   贷款合同中会明确罚息的计算方式（如日利率、月利率）及收取周期。若合同约定“按日计息，按月收取”，则罚息会每日累积，每月固定日期从还款账户扣划；若约定“一次性计收”，则可能在逾期满一定期限后（如30天）一次性扣除。但实践中，按日或按月计收更为常见，以持续督促借款人还款。

2. 罚息计算规则
   罚息一般以“逾期本金×罚息利率×逾期天数”计算。例如，若日罚息利率为0.05%，逾期1万元，则每日罚息为5元，按月收取时，30天罚息为150元。无论是否一次性扣除，罚息均会随逾期时间增加而累积。

3. 银行实际操作
   多数银行会在还款日次日开始计收罚息，并通过系统自动扣划。若还款账户余额不足，罚息会持续累积，直至借款人补足欠款或银行采取进一步措施（如催收、起诉）。即使部分银行允许“一次性协商还款”，罚息仍可能按实际逾期天数计算，仅在还款时统一结算。

4. 法律与监管要求
   根据《中国人民银行关于人民币贷款利率有关问题的通知》，逾期贷款罚息利率可在借款合同载明的贷款利率水平上加收30%-50%。法律未强制要求罚息扣除方式，但需确保计息规则透明、合理，不得变相提高利率。

建议：

• 查阅贷款合同“违约责任”条款，明确罚息计算及收取方式；
  
• 若发现银行违规计收罚息（如利率超标、未明确告知），可要求调整或投诉；
  
• 逾期后尽快还款，避免罚息持续累积导致债务扩大。
  

如有具体合同条款或银行操作疑问，可直接向我提供细节，进一步分析。