结论：在盗窃5000元并取得受害人谅解书的情况下，检察院仍有可能根据案件的具体情况和法律规定决定是否起诉。谅解书是量刑时的一个考虑情节，但并非决定案件是否起诉的唯一因素。
谅解书的作用与限制
谅解书在刑事案件中确实具有一定的作用，它体现了犯罪嫌疑人或被告人的悔罪表现，同时也显示了被害人对犯罪行为的宽容态度。然而，必须明确的是，谅解书并不是决定案件是否起诉的决定性因素。检察院在决定是否起诉时，会综合考虑多个方面，包括犯罪事实、证据是否充分、犯罪嫌疑人或被告人的社会危险性等。
可能起诉的情况
法律规定：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，若犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，且依法应当追究刑事责任，检察院应当作出起诉决定。这意味着，即便有谅解书，只要犯罪事实清楚、证据确凿，检察院仍有权提起公诉。
实例说明：以盗窃5000元为例，这一数额已经达到了盗窃罪的追诉标准。如果犯罪嫌疑人在盗窃过程中还伴有其他恶劣情节，如入室盗窃、多次盗窃等，那么即使取得了受害人的谅解书，检察院也可能会基于犯罪的严重性和社会危害性决定提起公诉。
可能不起诉的情况
相对不起诉：依据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。如果盗窃数额较小、情节较轻，并且取得了被害人谅解，检察院可能会基于宽严相济的刑事政策作出不起诉决定。但这种情况相对较少见，且需要满足严格的条件。
法定不起诉：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，若存在情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪等情形，检察院应当作出不起诉决定。然而，在盗窃5000元的情况下，这一数额已经达到了盗窃罪的追诉标准，因此很难被认定为情节显著轻微、危害不大。不过，如果盗窃行为本身存在其他特殊情况，如因生活所迫而一时冲动实施盗窃，且事后积极退赃、取得谅解等，检察院在综合考虑后可能会作出不起诉决定。但这种情况同样需要满足严格的条件，并且较为罕见。
谅解书在量刑中的作用
虽然谅解书不能直接决定案件是否会被起诉，但它可以作为量刑时的一个考虑情节。在法院审理阶段，如果被告人能够积极赔偿被害人的损失并取得谅解，这可能会对其量刑产生积极影响。例如，法院可能会在量刑时考虑从轻或减轻处罚。
总结与建议：
在处理盗窃案件时，即使犯罪嫌疑人取得了受害人的谅解书，也不能保证检察院不会起诉。因此，建议犯罪嫌疑人及其家属尽早咨询专业律师，以获取准确的法律意见和帮助。律师将根据案件的具体情况，为当事人提供有针对性的法律分析和建议，以确保其合法权益得到最大程度的保护。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。