贷款中介签协议按还款期数收手续费是否合法，需分情况讨论：

1. 若手续费性质为服务费且合理透明：

   • 贷款中介在提供服务时，有权根据服务内容和成本收取合理的服务费。若手续费被明确界定为服务费，且其金额与中介提供的服务（如协助申请贷款、审核资料、协调银行等）相匹配，同时双方在协议中清晰约定了收费方式和标准，那么这种收费方式通常是合法的。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》中关于合同自由和等价有偿的原则，双方有权在平等、自愿的基础上约定服务费用。

2. 若手续费被认定为利息或变相利息：

   • 如果贷款中介收取的手续费实际上构成了对贷款利息的额外收取，或者通过分期收取手续费的方式变相提高了贷款利率，那么这种收费方式可能违反了相关法律法规对贷款利率的限制。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》及《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》，借贷双方约定的利率不得超过合同成立时一年期贷款市场报价利率的四倍。若手续费导致实际利率超过此限制，则可能被视为不合法。

3. 若手续费收取存在欺诈或隐瞒：

   • 如果贷款中介在签订协议时未明确告知手续费的具体金额和收取方式，或者通过虚假宣传、误导性陈述等手段诱使借款人签订协议，那么这种收费方式不仅不合法，还可能构成欺诈行为。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国消费者权益保护法》，消费者享有知悉其购买、使用的商品或者接受的服务的真实情况的权利。贷款中介有义务向借款人提供真实、准确的信息。

建议与风险提示：

• 在与贷款中介签订协议前，务必仔细阅读协议条款，特别是关于手续费的部分，确保自己完全理解并同意其中的内容。
• 如果对协议条款有任何疑问或不确定的地方，应及时向贷款中介提出并要求解释清楚。
• 保留好所有与贷款中介的沟通记录和协议文本，以备不时之需。
• 如果发现贷款中介存在欺诈或违法行为，应及时向相关部门举报并寻求法律帮助。

总结：贷款中介签协议按还款期数收手续费是否合法，取决于手续费的性质、金额以及双方在协议中的约定。在签订协议前，借款人应充分了解并评估相关风险，确保自己的合法权益得到保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。