结论：您儿子银行卡是否会被冻结，取决于贷款合同中的具体约定、贷款逾期情况以及银行或贷款机构的追偿措施，无法直接给出肯定或否定的结论。以下从不同角度进行分析：
一、贷款合同约定
共同借款人或担保人情况：
- 如果您儿子是贷款的共同借款人或担保人，且贷款合同中明确约定了借款人或担保人需承担还款责任，那么在贷款逾期后，银行或贷款机构有权根据合同约定采取追偿措施，包括但不限于冻结您儿子的银行账户。
资金用途与合同关联性：
- 如果卖房所得款项中转入您儿子账户的部分被明确用于偿还该笔贷款（尽管实际上并未偿还），且贷款合同中有相关约定，银行或贷款机构可能会认为您儿子与贷款存在直接关联，从而采取相应措施。但这种情况较为特殊，需要具体合同条款和实际情况来判定。
二、贷款逾期情况
逾期时间与程度：
- 贷款逾期的时间长短和逾期程度（如逾期金额、逾期次数等）会影响银行或贷款机构的追偿决策。一般来说，逾期时间越长、逾期程度越严重，银行或贷款机构采取更严厉措施（如冻结账户）的可能性就越大。
银行或贷款机构的政策：
- 不同银行或贷款机构对于贷款逾期的处理政策可能有所不同。有些机构可能在逾期初期就采取冻结账户等措施，而有些机构则可能先通过催收、协商等方式解决。
三、银行或贷款机构的追偿措施
法律途径：
- 银行或贷款机构在贷款逾期后，通常会先通过电话、短信、邮件等方式进行催收。如果催收无果，他们可能会选择通过法律途径来追偿，包括但不限于起诉借款人、申请强制执行等。在法律程序中，如果法院判决借款人需偿还贷款，且借款人未履行判决，法院有权冻结借款人的银行账户。
非法律途径：
- 除了法律途径外，银行或贷款机构还可能采取一些非法律途径来追偿，如与借款人协商分期还款、调整还款计划等。这些措施通常不会直接导致银行账户被冻结。
四、建议与措施
查看贷款合同：
- 建议您首先查看贷款合同中的相关条款，了解您儿子在贷款中的具体角色和责任。
与银行或贷款机构沟通：
- 主动与银行或贷款机构沟通，了解贷款逾期情况、追偿措施以及可能的解决方案。
寻求法律帮助：
- 如果您认为银行或贷款机构的追偿措施不当或存在争议，可以寻求法律帮助来维护自身权益。
后续思考：在处理此类问题时，应充分考虑贷款合同的具体约定、贷款逾期情况以及银行或贷款机构的追偿措施。同时，建议保持与银行或贷款机构的良好沟通，积极寻求解决方案以避免不必要的法律纠纷。如果您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。