部分货款需要支付违约金是合法的，但具体合法性需根据合同条款及法律规定综合判断。以下从不同角度为您详细分析：

1. 合同自由原则下的合法性

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方有权在合同中约定违约金条款。这意味着，如果货物买卖合同中明确约定了“部分货款未支付需支付违约金”，且该条款不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该条款是合法的，对双方具有约束力。

举例：假设甲乙双方签订了一份货物买卖合同，约定甲方向乙方购买一批货物，总价款为100万元，其中80万元为货款，20万元为预付款。合同中同时约定，如果甲方未按时支付80万元货款中的任何一部分，需按照未支付金额的每日万分之五支付违约金。在此情况下，如果甲方确实未按时支付部分货款，那么按照合同约定支付违约金是合法的。

2. 违约金数额的合理性

虽然合同双方可以约定违约金，但违约金的数额应当合理。如果违约金数额过高或过低，可能面临被法院调整的风险。根据《民法典》的规定，约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。

举例：继续上述例子，如果合同中约定的违约金为未支付金额的每日百分之五，这显然过高。在甲方未按时支付部分货款的情况下，乙方虽然有权要求甲方支付违约金，但如果违约金数额过高，甲方可以向法院或仲裁机构请求减少违约金数额。

3. 实际履行与违约金的关系

在货物买卖合同中，如果一方未按时支付部分货款，另一方除了可以要求支付违约金外，还可以要求实际履行合同，即要求对方支付剩余货款。当然，如果合同已经无法实际履行（如货物已经灭失或无法交付），那么另一方只能要求支付违约金或赔偿损失。

建议：

• 审查合同条款：在签订货物买卖合同时，务必仔细审查合同中的违约金条款，确保其合法、合理且明确。
• 及时沟通协商：如果一方未按时支付部分货款，另一方应及时与对方沟通协商，了解原因并寻求解决方案。
• 依法维权：如果协商无果，另一方可以依法向法院或仲裁机构提起诉讼或仲裁申请，要求对方支付违约金或赔偿损失。

如果您在货物买卖合同中遇到了关于违约金的问题，或者有任何其他法律疑问，都可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业、全面的法律建议。