通过下游供应商向甲方提供回扣是违法的。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律定性
商业贿赂行为：
- 根据《中华人民共和国反不正当竞争法》及相关规定，经营者不得采用财物或者其他手段进行贿赂以销售或者购买商品。在交易活动中，经营者以明示方式向交易相对方支付折扣，或者向中间人支付佣金，且如实入账的，不属于贿赂行为。但通过下游供应商向甲方提供回扣，往往并非明示且未如实入账，因此构成商业贿赂。
违反刑法规定：
- 如果回扣行为情节严重，可能构成刑法中的对非国家工作人员行贿罪或行贿罪。具体取决于甲方的身份（是否为国家工作人员）以及回扣的数额、情节等因素。
二、法律后果
行政处罚：
- 工商行政管理部门可以对实施商业贿赂行为的经营者进行行政处罚，包括罚款、没收违法所得等。
刑事责任：
- 如前所述，如果回扣行为构成犯罪，将依法追究刑事责任。这可能导致有期徒刑、拘役、罚金等严重后果。
民事赔偿：
- 如果回扣行为导致其他经营者遭受损失，受害者有权要求赔偿。
三、实务建议
避免回扣行为：
- 企业在经营过程中应严格遵守法律法规，避免任何形式的回扣行为。这不仅是法律要求，也是维护企业声誉和长期发展的需要。
建立合规制度：
- 企业应建立完善的合规制度，明确禁止回扣等不正当竞争行为，并对员工进行合规培训。
及时咨询律师：
- 如果企业在经营过程中遇到涉及回扣等法律问题，应及时咨询专业律师，以便得到准确的法律意见和指导。
四、特殊情况说明
- 如果下游供应商与甲方之间的交易是合法的，且回扣是以明示方式支付并如实入账的，那么这种行为可能不构成违法。但在实际操作中，这种情况较为罕见，且需要严格的财务和法律合规程序来支持。
总结来说，通过下游供应商向甲方提供回扣是违法的，可能面临行政处罚、刑事责任以及民事赔偿等法律后果。因此，企业在经营过程中应严格遵守法律法规，避免任何形式的回扣行为。如果您在合同纠纷方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。