《劳动合同法》对用人单位劳动规章制度适用的限制主要体现在内容合法性、制定程序合法性以及公示告知义务三个方面。以下是对这三个方面的详细解释：
内容合法性限制
不得违反法律法规：用人单位制定的劳动规章制度必须符合国家法律法规的规定，不得与法律法规相抵触。例如，规章制度中不能规定低于法定标准的工资支付、加班费计算等，否则这些条款将被视为无效。
不得侵犯劳动者权益：规章制度的内容应当尊重和保护劳动者的合法权益，不得侵犯劳动者的人身权利、民主权利和经济利益。如规章制度中不能包含对劳动者的歧视性条款，或者不合理地限制劳动者的休息休假权利等。
制定程序合法性限制
民主制定程序：根据《劳动合同法》的规定，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。这一程序确保了规章制度的制定过程具有民主性和透明度。
平等协商原则：在制定规章制度的过程中，用人单位应当与工会或者职工代表进行平等协商，充分听取和考虑他们的意见和建议。这有助于确保规章制度的内容更加合理和公正，减少因规章制度不合理而引发的劳动争议。
公示告知义务限制
公示义务：用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。这是确保劳动者了解并遵守规章制度的重要前提。如果用人单位未履行公示或告知义务，那么这些规章制度对劳动者将不产生法律效力。
告知方式：公示或告知的方式可以多种多样，如通过内部网站、公告栏、电子邮件等方式进行。但无论采用何种方式，都应当确保劳动者能够方便、快捷地获取到规章制度的内容。
若用人单位违反上述限制，其制定的劳动规章制度可能被认定为无效，无法对劳动者产生约束力。在劳动争议中，如果用人单位依据无效的规章制度对劳动者进行处理，那么这种处理行为将被视为违法，用人单位可能需要承担相应的法律责任，如支付赔偿金、恢复劳动关系等。
建议：用人单位在制定劳动规章制度时，应当严格遵守法律法规的规定，确保规章制度的内容合法、程序合法，并履行公示告知义务。同时，用人单位也应当定期对规章制度进行审查和更新，以确保其始终符合法律法规的要求和企业的实际情况。如果有任何关于劳动规章制度制定或适用的法律问题，可以直接向我咨询。