结论前置：被判六年有期徒刑，已羁押二年的情况下，主要涉及的是刑期折抵和剩余刑期的执行问题。以下是具体分析：

1. 刑期折抵：

   • 根据《中华人民共和国刑法》第四十一条的规定，管制的刑期，从判决执行之日起计算；判决执行以前先行羁押的，羁押一日折抵刑期二日。但此条针对的是管制刑。
   • 对于有期徒刑，根据《中华人民共和国刑法》第四十七条，有期徒刑的刑期，从判决执行之日起计算；判决执行以前先行羁押的，羁押一日折抵刑期一日。因此，已羁押的二年将直接折抵为已执行的刑期，即从六年有期徒刑中扣除二年，剩余四年刑期待执行。

2. 剩余刑期的执行：

   • 剩余四年刑期，罪犯将被送至监狱或其他执行场所继续服刑。
   • 在服刑期间，罪犯需遵守监狱的规章制度，参加劳动改造和教育改造，争取减刑或假释的机会。
   • 减刑方面，根据《中华人民共和国刑法》第七十八条，被判处管制、拘役、有期徒刑、无期徒刑的犯罪分子，在执行期间，如果认真遵守监规，接受教育改造，确有悔改表现的，或者有立功表现的，可以减刑。
   • 假释方面，根据《中华人民共和国刑法》第八十一条，被判处有期徒刑的犯罪分子，执行原判刑期二分之一以上，如果认真遵守监规，接受教育改造，确有悔改表现，没有再犯罪的危险的，可以假释。但需注意，对累犯以及因故意杀人、强奸、抢劫、绑架、放火、爆炸、投放危险物质或者有组织的暴力性犯罪被判处十年以上有期徒刑、无期徒刑的犯罪分子，不得假释。

3. 其他注意事项：

   • 罪犯在服刑期间，其家属有权探视，但需遵守监狱的探视规定。
   • 罪犯在服刑期间，其合法权益受法律保护，如受到不公正对待，可依法维权。
   • 罪犯出狱后，应遵守法律法规，重新融入社会，开始新的生活。

总结：被判六年有期徒刑，已羁押二年的情况下，已羁押的二年将直接折抵为已执行的刑期，剩余四年刑期待执行。在服刑期间，罪犯需遵守规定，争取减刑或假释的机会。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。