结论：公司有司法案件但一般账户未被冻结时，能否注销需分情况讨论，具体取决于案件性质、账户状态及法律程序要求。以下是详细分析：

1. 若案件与账户无直接关联，且账户未被限制

• 可注销情形：若司法案件仅涉及公司其他资产或业务（如合同纠纷、知识产权侵权等），且一般账户未被法院采取保全措施（如冻结、查封），理论上公司可依法申请注销。
  
• 操作要点：需确保注销程序符合《公司法》规定，包括清算组成立、债权债务公告、税务注销等。若注销过程中被法院或债权人提出异议，可能面临程序中断风险。

2. 若案件可能导致账户被后续冻结或执行

• 风险情形：即使当前账户未被冻结，若案件涉及公司债务或赔偿责任（如未决诉讼、仲裁），法院可能根据债权人申请在判决后冻结账户。此时注销公司可能被认定为逃避债务，面临法律责任。
  
• 法律后果：根据《公司法》及《民事诉讼法》，恶意注销以规避执行可能被撤销注销登记，公司股东或实际控制人需承担连带清偿责任。

3. 若账户被隐含限制（如协助执行通知）

• 特殊情形：部分案件中，法院可能向银行发出“协助执行通知书”，要求限制账户资金流出但未正式冻结。此时银行可能拒绝注销申请。
  
• 应对建议：需通过法院或银行确认账户状态，避免因信息不对称导致注销失败或法律风险。

实务建议

1. 全面核查案件影响：联系办案法院或律师，确认案件是否涉及账户保全或未来执行风险。
   
2. 优先处理债务：若存在未决债务，建议通过和解、担保等方式化解风险后再注销。
   
3. 合规注销流程：严格履行清算义务，保留完整财务记录，避免因程序瑕疵被追责。
   

提示：公司注销涉及复杂法律程序，建议根据具体案件情况制定方案。如有疑问，可直接向我提供案件细节，我将进一步分析风险点。