核心前提：用户咨询的是在完工令下达后，针对已完成的工程部分应如何处理的问题，这通常涉及工程结算、验收、质量保证及可能存在的纠纷处理等法律环节。

结论与说明：

1. 工程结算与支付：

   • 核心结论：完工令下达后，首要任务是进行工程结算，确保承包方获得应得的工程款项。
   • 详细说明：根据合同条款，发包方应在完工令下达后的一定期限内（如合同约定的结算周期）完成工程量的核算与工程款的支付。若发包方拖延支付，承包方有权依据合同及法律规定，通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式追讨工程款。

2. 工程验收与移交：

   • 核心结论：完工令下达后，需进行工程验收，确保工程质量符合合同要求，随后进行工程移交。
   • 详细说明：验收过程中，应严格按照合同约定的验收标准进行，包括但不限于工程质量、安全性能、环保要求等。验收合格后，双方应签署工程移交证书，明确工程移交的时间、地点、条件及后续维护责任等。若验收不合格，承包方需按要求进行整改，直至验收通过。

3. 质量保证与保修：

   • 核心结论：完工令下达后，承包方仍需承担一定期限内的质量保证与保修责任。
   • 详细说明：根据合同约定及法律规定，承包方应在工程完工后的一定期限内（如质量保修期）对工程质量问题负责，进行无偿维修或更换。若因承包方原因导致的质量问题给发包方造成损失，承包方还需承担相应的赔偿责任。

4. 纠纷处理与法律救济：

   • 核心结论：若在完工令下达后出现纠纷，双方应首先通过协商解决，协商不成可依法寻求法律救济。
   • 详细说明：纠纷可能涉及工程款支付、工程质量、工期延误等多个方面。在处理纠纷时，双方应依据合同条款及法律规定，通过友好协商、第三方调解、仲裁或诉讼等方式解决。若选择仲裁或诉讼，应确保仲裁协议或诉讼管辖的约定明确、有效。

建议：针对完工令下达后的工程处理，建议双方严格遵守合同条款及法律规定，确保工程结算、验收、移交及质量保证等环节的顺利进行。若出现纠纷，应及时寻求法律帮助，通过合法途径维护自身权益。如有具体法律问题，欢迎直接向我咨询。