在多层转包分包关系中，认定违法行为主要依据的是相关法律法规对转包和分包行为的明确界定。以下是从不同角度对如何认定违法行为的详细分析：
一、违法转包的认定
整体转包：
- 承包单位将其承包的全部工程转给其他单位（包括母公司承接工程后将所承接工程交由具有独立法人资格的子公司施工的情形）或个人施工的，属于违法转包。
- 法律依据：根据《中华人民共和国建筑法》和《中华人民共和国民法典》的相关规定，承包单位不得将其承包的全部工程转包给他人。
肢解转包：
- 承包单位将其承包的全部工程肢解以后，以分包的名义分别转给其他单位或个人施工的，也构成违法转包。
- 法律依据：这种行为规避了法律对整体转包的限制，但实质上仍然是整体工程的转让，违反了相关法律法规。
管理缺失：
- 施工总承包单位或专业承包单位未派驻项目负责人、技术负责人、质量管理负责人、安全管理负责人等主要管理人员，或派驻的人员与施工单位没有订立劳动合同且没有建立劳动工资和社会养老保险关系，或派驻的项目负责人未对该工程的施工活动进行组织管理，又不能进行合理解释并提供相应证明的，认定为违法转包。
- 法律依据：这体现了承包单位对工程管理的缺失，不符合法律法规对承包单位管理责任的要求。
材料设备采购：
- 合同约定由承包单位负责采购的主要建筑材料、构配件及工程设备或租赁的施工机械设备，由其他单位或个人采购、租赁，或施工单位不能提供有关采购、租赁合同及发票等证明，又不能进行合理解释并提供相应证明的，也被认定为违法转包。
- 法律依据：这反映了承包单位在工程实施过程中的不作为，违反了合同约定和法律法规。
二、违法分包的认定
资质不符：
- 总承包单位将建设工程分包给不具备相应资质条件的单位，构成非法分包。
- 法律依据：根据《中华人民共和国建筑法》和《建设工程质量管理条例》，承包工程的单位须持有依法取得的资质证书，并在其资质等级许可的业务范围内承揽工程。
未经许可：
- 建设工程总承包合同中未有约定，又未经建设单位认可，承包单位将其承包的部分建设工程交由其他单位完成，这种未经许可的分包行为也构成非法分包。
- 法律依据：这扰乱了正常的承包秩序，违反了法律法规对分包行为的规定。
主体结构分包：
- 施工总承包单位将建设工程主体结构的施工分包给其他单位，也构成非法分包。
- 法律依据：主体结构施工关乎工程质量和安全，应由总承包单位自行完成，不得分包。
再分包：
- 分包单位将其承包的建设工程再分包，同样构成非法分包。
- 法律依据：这容易导致管理混乱、质量安全隐患增加，违反了法律法规对分包层次和范围的规定。
三、法律后果
对于违法转包和非法分包行为，相关法律法规规定了严格的法律后果，包括但不限于：
- 行政处罚：责令改正，没收违法所得，处工程合同价款一定比例的罚款；可以责令停业整顿，降低资质等级；情节严重的，吊销资质证书。
- 民事责任：违法分包中，总承包单位与分包单位对建设单位承担连带责任；转包中，转包人与实际施工人对工程质量等对发包人承担连带责任。
四、建议与措施
为了避免违法转包和非法分包行为的发生，建议各相关单位和个人：
- 严格遵守法律法规：自觉遵守《中华人民共和国建筑法》、《中华人民共和国民法典》等相关法律法规的规定，规范自身行为。
- 加强合同管理：在签订合同时，明确约定分包范围和条件，未经发包方同意不得擅自分包或转包。
- 强化项目管理：派驻合格的管理人员对工程进行组织管理，确保工程质量和安全。
- 及时咨询专业律师：在遇到法律问题时，及时咨询专业律师以获取准确的法律意见和帮助。
在实际操作中，如果发现违法转包或非法分包行为，应及时向相关部门举报并依法进行查处。同时，各相关单位和个人也应加强自我约束和自我管理，共同营造一个健康、有序的建筑市场环境。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询。