核心结论：协议还款承诺中未按时还款时违约金的收取，需依据协议约定、法律规定及实际损失情况综合确定，具体分析如下：

1. 协议优先原则
   若还款承诺协议中明确约定了违约金条款（如“逾期每日按未还金额的0.1%支付违约金”），则应优先按协议执行。但需注意：

   • 违约金上限：根据《民法典》第五百八十五条，若约定的违约金过分高于实际损失（通常指超过损失的30%），法院或仲裁机构可依申请调整。例如，若实际损失仅为利息损失，但约定违约金为未还金额的50%，则可能被调减。
     
   • 举证责任：主张调整违约金的一方需证明实际损失低于约定金额，否则法院可能支持协议原条款。

2. 无协议时的处理
   若协议未约定违约金，但约定了逾期利息或其他责任，可按以下方式主张：

   • 逾期利息：若协议约定了逾期利率（如LPR的1.5倍），可要求按约定利率支付资金占用费。
     
   • 实际损失赔偿：若无利息约定，可主张赔偿实际损失（如因对方违约导致的额外融资成本、诉讼费用等），但需提供证据证明损失与违约行为的因果关系。

3. 操作建议

   • 书面催告：在起诉前，应先通过书面形式（如律师函）催告对方履行还款义务，并明确逾期后果（如支付违约金或利息），为后续诉讼固定证据。
     
   • 诉讼时效：注意诉讼时效为3年，自还款期限届满之日起算，逾期可能丧失胜诉权。
     
   • 证据收集：保留协议原件、转账记录、催告记录等证据，以证明对方违约及己方损失。

示例：若协议约定“逾期每日按未还金额的0.1%支付违约金”，但对方逾期100天未还10万元，则按协议可主张1万元违约金。若对方主张违约金过高，需举证证明实际损失（如银行同期贷款利息仅为5000元），则法院可能调减违约金至6500元（5000元×130%）。

如有具体协议条款或案件细节，可进一步提供，我将结合实际情况分析。