针对您提出的“退耕还林工程宜林荒山现在三调为基本农田是否可以申请退林还耕”的问题，我们需要结合自然资源部和国家林业和草原局发布的关于以第三次全国国土调查成果为基础明确林地管理边界、规范林地管理的通知来进行详细分析。

首先，我们要明确的是，根据通知精神，林地管理应坚持统一底图、统一标准、统一调查的原则，并以“三调”成果为统一底版进行规范管理。这意味着，地类的认定和管理应以最新的国土调查结果为准。

对于您提到的具体情况，即原本为退耕还林工程的宜林荒山，现在“三调”中被认定为基本农田，我们需要考虑以下几点：

1. 地类变更的合法性：根据通知，地类的变更应遵循依法依规、实事求是的原则。如果“三调”结果确实显示该地块为基本农田，那么这一变更应被视为合法有效的。

2. 退林还耕的适用性：通知中并未直接提及退林还耕的具体政策，但提到了要区分耕地上造林情形，实行差别化管理。对于原本为耕地、后实施退耕还林的地块，如果现在“三调”为林地且不属于按照国家政策和标准建设的防护林和绿色通道等，且在农民依法承包经营的耕地上种树的，可以逐步恢复为耕地。然而，您的情况是原本为宜林荒山（可能原本非耕地），现在“三调”为基本农田，这并不直接符合上述退林还耕的适用情形。

3. 基本农田的保护：基本农田是受到严格保护的耕地类型，用于确保国家的粮食安全。因此，将基本农田转为其他用途（包括退林还耕的逆向操作，即如果原本非耕地现在为基本农田则不应再转为非耕地用途）通常需要经过严格的审批程序，并符合相关的土地利用规划和政策要求。

4. 实际操作建议：

   • 咨询当地部门：建议您首先咨询当地的自然资源主管部门和林草主管部门，了解该地块的具体情况和相关政策要求。
   • 遵循规划要求：如果确实需要改变该地块的用途，应确保符合当地的国土空间规划和“三区三线”划定成果。
   • 办理相关手续：如果符合政策要求并决定进行地类变更，应按照规定办理相关的审批和登记手续。

综上所述，虽然您提到的地块现在“三调”为基本农田，但并不能直接据此申请退林还耕。是否可以进行地类变更以及如何进行变更，需要综合考虑当地的政策要求、规划情况以及实际用途等因素，并咨询相关部门进行具体操作。