在餐饮店亏损的情况下，股东退股的清算工作需要遵循一定的流程和方法，以确保清算的公正、合理和合法。以下是一个详细的清算步骤指南：

一、确定公司资产状况

1. 全面清查资产：首先，需要对餐饮店的固定资产（如厨房设备、桌椅、装修等）、流动资产（如库存食材、现金等）以及无形资产（如品牌价值、专利等）进行全面清查。
2. 核实资产价值：通过专业的评估或市场调研，核实各类资产的实际价值，确保评估结果的公正性和准确性。

二、梳理公司负债情况

1. 列出负债清单：梳理餐饮店的各类应付账款、借款、员工工资、税费等负债，明确债务的具体金额和偿还期限。
2. 确认债务真实性：与债权人沟通，确认债务的真实性和准确性，避免遗漏或重复计算。

三、核算公司经营成果

1. 计算盈利或亏损：依据财务报表、账目记录等资料，准确统计餐饮店的经营成果，即计算盈利或亏损状况。
2. 分析亏损原因：如果餐饮店处于亏损状态，需要深入分析亏损的原因，如成本控制不当、市场竞争激烈、经营管理不善等，以便为后续的清算和决策提供依据。

四、计算退股股东应得剩余财产

1. 计算公司净资产：用公司总资产减去总负债，得到公司的净资产。
2. 按股权比例分配：根据退股股东的持股比例，计算其应得的剩余财产。具体公式为：退股股东应得剩余财产 = 公司净资产 × 退股股东持股比例。

五、确保清算过程合法合规

1. 遵循会计准则：在清算过程中，要确保财务数据的真实、准确、完整，遵循相关会计准则和法律法规要求。
2. 合理公正评估：所有资产的评估作价应合理公正，避免高估或低估资产价值。
3. 合法合规处理债务：债务的认定与处理要合法合规，确保债权人的权益得到保障。

六、协商与争议解决

1. 股东协商：对于清算过程中存在争议的事项，股东之间应充分协商沟通，寻求共识。
2. 引入专业机构：必要时，可引入专业的审计、评估机构协助清算工作，以确保清算的公正性和准确性。

七、完成清算并办理相关手续

1. 编制清算报告：根据清算结果，编制详细的清算报告，明确清算过程、结果及各方权益。
2. 办理工商变更：完成清算后，需要到工商部门办理股东变更等相关手续，确保公司登记信息的准确性和合法性。

在整个清算过程中，建议退股股东与餐饮店管理层保持密切沟通，确保清算工作的顺利进行。同时，如果涉及复杂的法律或财务问题，建议咨询专业的律师或会计师以获取更准确的指导和建议。