刑事案件程序违法主要包括以下情形：
侦查阶段程序违法：
- 先裁决后取证：侦查机关在未取得充分证据的情况下，就先行对案件作出裁决，这严重违反了刑事诉讼的“以事实为依据，以法律为准绳”原则。
- 未依法告知犯罪嫌疑人诉讼权利：侦查机关在讯问犯罪嫌疑人时，未依法告知其享有的诉讼权利，如申请回避、辩护等，这侵犯了犯罪嫌疑人的合法权益。
- 非法搜查：侦查机关未经合法程序，擅自对犯罪嫌疑人的住所、身体等进行搜查，这违反了法律对搜查程序的严格规定。
- 刑讯逼供：侦查机关通过暴力、威胁等手段逼取犯罪嫌疑人的口供，这是严重的程序违法行为，也是导致冤假错案的重要原因之一。
- 超时限询问查证：侦查机关在询问查证过程中，超过了法律规定的时限，这侵犯了犯罪嫌疑人的休息权和其他合法权益。
起诉阶段程序违法：
- 未依法讯问犯罪嫌疑人：检察机关在审查起诉过程中，未依法对犯罪嫌疑人进行讯问，这可能导致对案件事实的认定不准确。
- 未严格遵循法定程序审查起诉：检察机关在审查起诉时，未按照法律规定的程序进行，如未审查案件证据是否充分、是否合法等，这可能导致起诉决定的不准确。
审判阶段程序违法：
- 未保障被告人的辩护权：法院在庭审过程中，未依法保障被告人的辩护权，如未允许被告人充分陈述、辩解，或未为被告人提供必要的辩护条件等。
- 未依法回避：审判人员或其他诉讼参与人应当回避而未回避的，这可能影响案件的公正审理。
- 非法剥夺辩论权利：法院在庭审过程中，非法剥夺了当事人或其他诉讼参与人的辩论权利，如未允许当事人充分发表意见、进行辩论等。
- 在证据认定、法律适用等方面违反程序规定：法院在审理案件时，未按照法律规定的程序对证据进行认定、对法律进行适用，如未依法排除非法证据、未正确适用法律条款等。
程序违法的法律后果：
程序违法不仅可能影响案件的公正处理，导致案件结果存在瑕疵，还可能严重侵犯当事人的合法权益。在严重的情况下，程序违法甚至可能导致案件被撤销或改判。因此，在刑事案件中，必须严格遵守法定程序，以确保司法公正和当事人的合法权益。
建议：
如果您或您身边的人遇到了刑事案件程序违法的情况，建议及时收集相关证据，并向有关部门进行反映或申诉。同时，也可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况，提供专业的法律意见和帮助。