被宣告死亡的人重新出现且其配偶已死亡的情况下，婚姻关系不能自动恢复。以下是对此问题的详细分析：

一、法律原则与规定

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，被宣告死亡的人的婚姻关系，自死亡宣告之日起消除。若死亡宣告被撤销，婚姻关系原则上自撤销死亡宣告之日起自行恢复，但存在例外情形：

1. 配偶再婚：若在被宣告死亡的人重新出现或死亡宣告被撤销之前，其配偶已经与他人办理结婚登记结成新的婚姻关系，即使后来再婚关系结束（如离婚或再婚配偶死亡），原婚姻关系也不能自行恢复。

2. 配偶书面声明不愿恢复：即便配偶没有再婚，但如果其向婚姻登记机关书面声明不愿意恢复与原被宣告死亡人的婚姻关系，那么原婚姻关系同样不能自行恢复。

二、具体到本问题的分析

在本问题中，被宣告死亡的人重新出现时，其配偶已经死亡。这一情形并不属于上述法律规定的例外情形中的“配偶再婚”或“配偶书面声明不愿恢复”。然而，从逻辑上分析，配偶的死亡意味着其民事主体资格已经消灭，无法再与原被宣告死亡的人形成或恢复婚姻关系。婚姻关系是双方当事人之间的法律关系，需要双方均具备民事主体资格才能成立和存在。

三、法律后果与建议

1. 法律后果：由于配偶已经死亡，原婚姻关系无法自动恢复。被宣告死亡的人若希望建立新的婚姻关系，需要与其他符合法定条件的人重新办理结婚登记。

2. 建议：

   • 了解法律地位：被宣告死亡的人应首先了解自己的法律地位以及相关的权利义务。
   • 尊重配偶的死亡事实：配偶的死亡是一个不可逆转的事实，应尊重这一事实并接受其带来的法律后果。
   • 重新规划婚姻生活：若希望建立新的婚姻关系，应寻找合适的伴侣并依法办理结婚登记手续。

四、实际操作中的注意事项

• 咨询专业律师：虽然本问题已经给出了明确的法律分析，但在实际操作中，仍可能遇到各种复杂情况。因此，建议当事人在处理此类问题时咨询专业律师以获取更准确的法律意见和指导。
• 保留相关证据：在处理与婚姻关系相关的问题时，应保留好相关证据（如死亡证明、结婚证等），以便在需要时证明自己的法律地位和权利义务。

综上所述，被宣告死亡的人重新出现且其配偶已死亡的情况下，婚姻关系不能自动恢复。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。