设施农业用地建筑结构确实存在一定限制，这些限制主要体现在建筑用途、规模、选址以及生态保护等方面。以下是对这些限制的详细解读：

一、建筑用途限制

设施农业用地上的建筑必须直接服务于农业生产，如用于农作物种植、畜禽水产养殖的设施，以及与之紧密关联的晾晒场、粮食烘干设施、农资临时存放场所、大型农机具停放场所等。这些建筑不得擅自改变土地用途或进行非法转让，必须严格按照规定的用途使用。

二、建筑规模限制

1. 生产设施用地：根据生产需要确定用地规模。例如，看护房应执行“大棚房”问题专项清理整治整改标准，控制在“单层、15平方米以内，允许轻钢结构双层”。
2. 辅助设施用地：应合理控制规模。属于作物种植（含各类设施农业和农业规模种植）和水产养殖的，辅助设施用地规模原则上控制在项目用地规模7%以内，最多不超过15亩；属于畜禽养殖的，辅助设施用地规模原则上控制在项目用地规模10%以内。辅助设施用地面积无法满足环境保护相关要求的，可适当增加，但最多不超过项目用地规模15%。

三、建筑选址限制

设施农业用地的建设应选址于农业生产区域内，严禁占用永久基本农田。若因特殊原因需涉及少量永久基本农田，必须依法进行补划并经过相关部门审批。这一限制旨在保护耕地资源，确保农业生产的可持续性。

四、生态保护与恢复责任

设施建设应注重生态环境保护，避免对周边生态环境造成破坏。若因设施建设导致生态环境受损，应采取有效措施进行恢复和治理。这一要求体现了对生态环境保护的重视，也是设施农业用地建筑结构限制的重要组成部分。

五、具体设施用地标准

1. 畜禽舍：根据养殖规模和畜禽种类合理确定用地规模，并配备必要的环保设施以防止污染。
2. 工厂化作物栽培：根据栽培作物的种类、种植模式和生产规模来确定用地规模，并确保设施具备相应的农业生产功能和条件。
3. 水产养殖：根据养殖品种、方式和密度等因素确定用地规模，且设施应符合水资源保护和生态环境保护的要求。
4. 附属设施：如管理和生活用房、仓储及饲料加工等设施的用地规模应合理控制，并满足基本的生产和办公需求。

建议：在进行设施农业用地建设前，务必充分了解并遵守相关法律法规和政策要求，确保建设活动的合法性、合规性和可持续性。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。