刑事案件不起诉并不意味着事情就彻底结束了，这需要分情况来看，具体如下：
法定不起诉：
- 当犯罪嫌疑人具有《刑事诉讼法》第十六条规定的情形之一，如情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪等，检察院会作出法定不起诉决定。这种情况下，诉讼程序会终止，案件通常就此终结，不会再有刑事方面的后续处理。
酌定不起诉：
- 对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的情况，检察院可以决定酌定不起诉。虽然犯罪情节轻微，检察院作出了不起诉决定，但如果被害人不服，可在收到决定书后七日以内向上一级检察院申诉，请求提起公诉；上一级检察院应将复查决定告知被害人，对复查决定仍不服的，被害人可以向法院起诉。此外，检察院还可以根据案件的不同情况，对被不起诉人予以训诫或者责令具结悔过、赔礼道歉、赔偿损失，或者提出检察意见，移送有关主管机关给予行政处罚、行政处分。
证据不足不起诉：
- 如果检察院对于二次补充侦查的案件，仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，会作出证据不足不起诉的决定。但这并不意味着案件彻底结束，若之后发现新的证据，符合起诉条件，检察院可能会重新提起公诉。
后续可能存在的程序：
- 被害人申诉或起诉：对于有被害人的案件，被害人如果不服不起诉决定，在规定期限内有向上一级检察院申诉的权利，若检察院维持不起诉决定，被害人还可以向人民法院起诉，此时案件会进入法院审理程序。
- 公安机关复议、复核：公安机关对不起诉决定有异议的，可以要求复议，如果意见不被接受，还可向上一级人民检察院提请复核，检察院也会进行审查并作出相应决定。
- 行政处罚：即便检察院不起诉，公安机关仍可能对相关行为进行行政处罚，被不起诉人在行政层面可能还需接受相应的处理。
因此，刑事案件不起诉后，是否就完事了，需要依据不同的不起诉类型，并结合后续可能发生的各种情况，才能进行全面准确的分析与判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。