在职期间签订的保密协议，若包含竞业限制条款，则通常有补偿；若仅为单纯的保密义务约定，则不一定有补偿，但有补偿约定更能平衡双方权利义务。以下从不同角度进行分析：
包含竞业限制条款的保密协议
法律要求：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。这一规定同样适用于在职期间，即若保密协议中包含了竞业限制条款，用人单位在劳动者履行竞业限制义务期间（包括在职期间的部分限制）应当支付经济补偿。
补偿目的：
- 给予补偿金是对劳动者因履行保密义务（特别是竞业限制义务）而可能遭受的利益损失的一种补偿。例如，劳动者因遵守保密协议，可能无法自由利用某些工作中获取的知识技能去从事其他类似工作，或者在工作选择上受到一定限制。
补偿标准：
- 补偿标准目前法律无统一明确规定，实践中需综合考虑多因素，如商业秘密的价值、员工知悉商业秘密的程度与范围、员工离职后受限制的期限等。常见做法是，补偿金额可按照员工离职前一定比例的月工资来确定，比例范围较宽泛，可能在月工资的20%-50%左右。双方也可根据实际情况协商确定合理的补偿标准，并在保密协议中明确约定。
单纯的保密义务约定（无竞业限制条款）
法定义务：
- 保密义务是员工基于诚实信用原则的法定义务，即使未约定补偿，员工也需保守企业商业秘密。因此，对于单纯的保密协议，只约定保密义务无补偿不必然无效。
补偿约定：
- 虽然无补偿约定的单纯保密协议不必然无效，但有补偿约定更能平衡双方权利义务。如果双方在保密协议中约定了补偿条款，那么用人单位应当按照约定支付补偿。
未约定补偿的处理：
- 若保密协议中未约定补偿，但劳动者履行了保密义务，且因保密义务受到了一定限制或损失，劳动者在特定情况下（如离职后）可能有权要求用人单位给予一定的经济补偿，但这通常需要依据具体案情和法律规定来判断。
实际操作建议
- 明确协议内容：在签订保密协议时，双方应明确协议中是否包含竞业限制条款以及补偿的具体金额和支付方式。
- 协商确定补偿：对于补偿标准，双方应根据实际情况协商确定，并在协议中明确约定，以避免后续纠纷。
- 依法维权：如果用人单位未按照协议约定支付补偿，劳动者可以依法维权，要求用人单位支付应得的补偿。
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