农用地转用批准为商业供地后，其用途是可以变更的，但必须严格遵循法律程序和审批流程。以下是对此问题的详细解析：
一、法律依据与原则
根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，国家实行土地用途管制制度，严格限制农用地转为建设用地，并控制建设用地总量。这意味着，任何土地用途的变更，尤其是农用地转为商业用地，都必须依法进行，并经过相关部门的严格审批。
二、变更用途的详细操作流程
咨询与规划：
- 向国土资源局、建设部门、规划部门咨询该农用地是否符合土地利用总体规划、城市建设总体规划和土地利用年度计划。
- 确认农用地可用于商业建设后，进行建设项目可行性论证，并提交用地申请。
预审与立项：
- 用地单位持相关材料向国土资源局提出用地预审申请，包括项目可行性研究报告、规划部门的选址意见书等。
- 预审通过后，办理立项、规划许可、环保许可等手续。
正式申请与审批：
- 用地单位持以上审批文件，向原预审的国土资源局提出项目用地的正式申请。
- 国土资源局拟定农用地转用方案、补充耕地方案等，并按规定的审批权限逐级报有批准权的人民政府审批。
缴纳费用与补偿：
- 获得批准后，用地单位需按规定缴纳新增建设用地土地有偿使用费等相关税费。
- 如涉及征收集体土地，国土资源局负责与农用地的所有权人和使用权人签订补偿安置协议，并按征地程序办理征地手续。
供地与出让：
- 在征地补偿、安置补助完成后，国土资源局向用地单位发出批准用地文件和《建设用地批准书》。
- 对于商业用地，通常通过招标、拍卖、挂牌等公开出让方式取得土地使用权。用地单位与国土资源部门签订土地出让合同，并缴纳土地出让金。
登记发证：
- 完成上述程序后，用地单位持相关批准文件和出让合同等资料，到不动产登记部门办理土地变更登记手续，领取新的不动产权证书，确认其商业用地的使用权。
三、注意事项与违规后果
- 严格遵守法律法规：在整个流程中，必须严格遵守相关法律法规，确保所有手续齐全、合法。任何未经批准擅自改变土地用途的行为，都属于违法行为，将面临严重的法律处罚。
- 咨询当地部门或律师：由于各地区具体规定可能有所不同，建议在实际操作中咨询当地相关部门或像我这样的专业律师，以确保操作的合规性。
- 违规后果：根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状；对符合土地利用总体规划的，没收在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，并可以并处罚款。同时，对非法占用土地单位的直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
总结：农用地转用批准为商业供地后，虽然可以变更用途，但必须依法依规进行，确保所有手续齐全、合法。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。