农村股份经济合作社改造并不必然导致土地承包经营权的回收，具体需结合改造方式、法律政策及合同约定综合判断。以下从不同角度展开分析：

1. 改造性质与法律关系
   若改造仅涉及合作社内部股权结构调整、管理机制优化或资产整合，而未改变土地承包关系（如承包方仍为原农户或集体成员），则土地承包经营权通常不受影响。根据《农村土地承包法》第9条，承包方依法享有的土地承包经营权受法律保护，任何组织和个人不得侵犯。

2. 土地权属变更的例外情形
   若改造过程中涉及土地用途变更（如农用地转为建设用地）、土地征收或集体经济组织重组，可能触发土地承包经营权的调整或收回。但需满足法定条件：

   • 法定程序：需经村民会议三分之二以上成员或村民代表同意，并报乡（镇）人民政府批准；
     
   • 补偿原则：若因公共利益需要收回土地，应依法给予合理补偿（《民法典》第338条）。

3. 合同约定优先
   若农户与合作社或集体经济组织签订的承包合同中明确约定了改造情形下的权利义务（如股权置换土地承包权、收益分配方式等），则以合同约定为准。此时需审查合同条款是否违反法律强制性规定。

建议：

• 核查改造方案是否涉及土地权属变更，并要求提供法律依据及补偿方案；
  
• 审查承包合同中关于改造的约定条款；
  
• 如遇争议，可要求召开村民会议或通过行政复议、诉讼途径维权。
  

如有具体案例或合同文本，可进一步提供细节以便针对性分析。