针对您提出的“刑事案件委托人与被委托人是父子关系但是不在一个户口本怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

在刑事案件中，如果委托人与被委托人（例如父子）不在同一个户口本上，但需要证明他们之间的亲属关系以进行委托或会见等法律程序，您可以采取以下步骤：

1. 准备身份证明：

   • 委托人和被委托人均需准备有效的身份证明，如身份证原件。

2. 获取亲属关系证明：

   • 由于不在同一户口本上，您需要获取能够证明父子关系的官方文件。这通常可以通过以下途径获得：
     • 公安派出所：您可以前往当地公安派出所，申请出具亲属关系证明。派出所会根据您的申请和提供的必要信息（如姓名、身份证号等）进行核实，并出具相应的证明文件。
     • 公证部门：您也可以选择前往公证部门进行亲属关系公证。公证部门会要求您提供相关证据材料，并进行核实后出具公证书，作为亲属关系的有效证明。
     • 其他官方机构：在某些情况下，乡镇、街道等官方机构也可能出具亲属关系证明，具体取决于当地的规定和流程。

3. 提交证明文件：

   • 在进行委托或会见等法律程序时，您需要将获取到的亲属关系证明文件与其他必要材料（如身份证原件）一同提交给相关部门或机构。

4. 遵循具体规定：

   • 需要注意的是，不同地区和不同机构对于亲属关系证明的要求可能有所不同。因此，在办理前最好先咨询相关部门或机构的具体要求，以确保您提供的证明文件符合规定。

5. 关注后续流程：

   • 提交证明文件后，您需要关注后续流程，如是否需要进一步核实信息、是否需要补充材料等。确保您按照相关部门或机构的要求及时完成后续步骤。

综上所述，即使委托人与被委托人不在同一个户口本上，您仍然可以通过获取官方出具的亲属关系证明文件来证明他们之间的亲属关系，并顺利进行委托或会见等法律程序。希望这些信息能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时咨询。