医药连锁公司在非法渠道购进药品1000万，若构成非法经营罪，且情节特别严重，是有可能被判刑的。具体分析如下：

一. 非法经营罪的定罪与量刑

1. 定罪标准：根据《中华人民共和国刑法》第二百二十五条的规定，违反国家规定，非法经营行为扰乱市场秩序，情节严重的，即构成非法经营罪。医药连锁公司在非法渠道购进药品，若该行为扰乱了市场秩序，且情节严重，则可能构成非法经营罪。
2. 量刑标准：对于非法经营罪，情节严重的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。

二. 具体案件分析

• 在本案中，医药连锁公司在非法渠道购进药品1000万，这一数额巨大，很可能被视为情节特别严重。若经法院审理认定构成非法经营罪，并判定情节特别严重，那么该公司及其相关责任人员将面临五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产的刑罚。

三. 结论与建议

• 结论：因此，医药连锁公司在非法渠道购进药品1000万，若构成非法经营罪且情节特别严重，是有可能被判刑的。
• 建议：对于此类行为，我建议企业应加强合规管理，严格遵守国家法律法规，确保药品来源的合法性。同时，对于已经发生的行为，应尽快咨询专业律师，了解可能的法律后果，并积极配合相关部门的调查处理。

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