房产证面积小于购房合同面积时，追诉时效为三年，自权利人知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。以下是对此问题的详细分析：

一、追诉时效的法律依据

根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这意味着，当购房者发现房产证上的面积小于购房合同中的面积时，他们有权在三年内提起诉讼，要求开发商承担相应的责任。

二、追诉时效的起算点

追诉时效的起算点是从权利人知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。在房产面积纠纷中，这通常指的是购房者发现房产证面积与合同面积不符，并意识到自己的权益可能受到损害的时刻。例如，购房者在办理房产证时发现面积差异，或者通过其他途径得知面积不符的情况，此时就可以视为追诉时效的起算点。

三、特殊情况下的处理

虽然追诉时效一般为三年，但法律也规定了特殊情况下的处理。例如，如果自权利受到损害之日起超过二十年，人民法院将不予保护。不过，如果有特殊情况，人民法院可以根据权利人的申请决定延长追诉时效。

四、面积差异的处理原则

当房产的实际面积与合同所述面积之间存在差异时，如果差值在百分之三范围内（包含该数值），购房者及开发商通常无需过于纠结。此时，购房者只需按照实际情况支付相应的房款即可。然而，如果面积差异超过百分之三，购房者就有权要求开发商承担相应的责任，包括但不限于退还多收的房款、赔偿损失等。

五、建议与提醒

1. 及时维权：一旦发现房产证面积与合同面积不符，购房者应及时与开发商沟通，并考虑通过法律途径维护自己的权益。不要拖延时间，以免错过追诉时效。
2. 保留证据：购房者应妥善保管购房合同、房产证等相关证据，以便在需要时提供证明。
3. 咨询专业律师：虽然我作为谢瑛律师可以为你提供专业的法律咨询，但在处理具体案件时，建议购房者还是咨询专业律师，以确保自己的权益得到充分保障。

如果你在房产面积纠纷方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。