关于电动自行车在过线时变绿灯怎样判断是否闯红灯的问题，这确实是一个需要细致理解交通规则的情况。
首先，我们要明确的是，闯红灯的判定并不完全取决于信号灯颜色的变化时刻，而是取决于车辆在红灯亮起时是否已经越过了停止线。具体来说：
红灯亮起前的行为：如果电动自行车在红灯亮起前已经完全越过了停止线，并且之后信号灯变为绿灯，那么这种情况通常不被视为闯红灯。因为车辆是在绿灯期间通过停止线的，红灯亮起时车辆已经处于合法通行状态。
红灯亮起时的行为：如果电动自行车在红灯亮起时或亮起后越过停止线，那么无论之后信号灯是否变为绿灯，这种行为都构成闯红灯。因为红灯是禁止通行的信号，越过停止线即意味着违反了交通规则。
特殊情况的处理：在实际交通中，可能会遇到一些特殊情况，如信号灯故障、交通管制等。在这些情况下，驾驶员应遵循现场交通警察的指挥或根据交通标志、标线的指示通行。如果因特殊情况导致误判闯红灯，可以向交通管理部门提出申诉。
接下来，为了更全面地理解这个问题，我们还需要了解电动自行车通过交叉路口时的一般规则：
遵守信号灯指示：电动自行车通过路口时，应严格遵守非机动车信号灯的指示。在没有非机动车信号灯的路口，则按照机动车信号灯的指示通行。
停止线等候：遇到停止信号时，电动自行车应在非机动车停止线或者待转区内顺序等候。如果没有停止线或待转区，则应停在路口以外，不得在非机动车禁驶区内停车。
避让行人：经过人行横道时，电动自行车要注意避让行人，确保行人的安全通行。
综上所述，判断电动自行车是否闯红灯，关键在于看车辆在红灯亮起时是否已经越过了停止线。同时，我们也应遵守交通规则，确保自己和他人的安全。希望这个解答能帮助您更好地理解交通规则，做到守法骑行。