如果您在高速通行时发现收费不合理，出现了多扣费的情况，您可以按照以下步骤来处理：

首先，您可以尝试拨打交通出行服务热线12328。在拨打电话时，请准备好您的联系方式、车牌号、出入口站点名称、行驶路径、收费金额以及收费凭证（如果是现金交费的话）。将这些信息提供给客服人员后，他们将会启动通行费退费流程，帮助您解决问题。

另外，您也可以选择通过电子邮件的方式来处理这个问题。将您的联系方式、车牌号、出入口站点名称、行驶路径、收费金额以及收费凭证（现金交费）等信息发送到指定的邮箱地址（如ynetctf@.com，但请注意，实际使用时需确认邮箱地址的准确性）。发送邮件后，相关部门将会启动退费流程，与您联系并处理退费事宜。

此外，我还了解到，相关部门将于近日推出退费申请小程序。一旦这个小程序测试合格并上线，您就可以通过它来更方便地提交退费申请了。当然，这个小程序上线后，相关部门会第一时间向社会公告，您可以关注相关公告以获取最新信息。

在处理这类问题时，我建议您保持耐心，并准备好所有相关的信息和凭证，以便能够更顺利地完成退费流程。同时，如果您对收费站设置、收费标准等相关信息有疑问，也可以随时向相关部门咨询，他们将会为您提供详细的解答。希望这些建议能够帮助您解决问题。