合同章并非由谁保管就由谁来盖，而是由公司根据自身情况和内部管理制度来决定保管主体，并在使用时遵循严格的审批和登记流程。以下是对这一问题的详细分析：

合同章的保管主体

1. 行政部门：行政部门负责公司日常行政管理工作，对公司整体运营情况较为了解。由其保管公章和合同章，便于统一管理和协调，也有利于规范用章流程。

2. 法务部门：法务部门熟悉法律法规和合同审查流程，能从法律风险防控角度对用章进行严格把控，确保公司行为合法合规，降低法律风险。

3. 财务部门：对于一些涉及财务相关合同和文件用章，部分公司会交由财务部门保管。财务部门在财务管理和资金运作方面具有专业性，能更好地配合财务工作的开展。

合同章的使用流程

无论合同章由哪个部门保管，公司都应建立完善的印章管理制度，明确用章审批流程、登记制度和责任追究机制。具体来说：

• 用章审批：每次使用合同章都必须经过严格的审批手续，不符合规定的文件、合同等，审批部门有权拒印。
• 用章登记：建立用章登记制度，每次使用合同章都需要填写公章使用登记表，记录用章时间、用章事由、用章人等信息。
• 责任追究：对于违规使用合同章的行为，公司应明确责任追究机制，确保印章使用安全、规范。

可能的法律后果

如果公司未建立完善的印章管理制度，或者未严格遵守用章审批和登记流程，可能会导致以下法律后果：

• 合同效力问题：未经审批或登记擅自使用合同章签订的合同，可能因程序瑕疵而被认定为无效合同。
• 法律责任承担：对于违规使用合同章的行为，相关责任人可能需要承担法律责任，包括民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。

建议

为了确保合同章的安全、规范使用，我建议公司：

1. 明确保管主体：根据公司实际情况和内部管理制度，明确合同章的保管主体。
2. 建立完善制度：制定完善的印章管理制度，明确用章审批流程、登记制度和责任追究机制。
3. 加强培训教育：对保管和使用合同章的人员进行培训教育，提高其法律意识和风险意识。

如果您在合同章保管和使用方面遇到任何问题，或者需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。