针对您提出的“交通运输部门对超载的处罚程序”这一问题，我将结合相关法规和实施细则，为您详细阐述处罚程序。
首先，需要明确的是，交通运输部门对超载的处罚主要依据《超限运输车辆行驶公路管理规定》以及地方性的实施细则，如《江苏省货运车辆超限超载“一超四罚”实施细则》等。这些规定和细则明确了超载的认定标准、处罚种类以及处罚程序。
一、超载的认定与处罚标准
根据《超限运输车辆行驶公路管理规定》，车辆违法超限运输的，由公路管理机构根据违法行为的性质、情节和危害程度给予处罚。具体标准如下：
- 车货总高度、宽度、长度超过规定标准的，根据超限程度处以200元至3000元不等的罚款。
- 车货总质量超过限定标准的，未超过1000千克的予以警告；超过1000千克的，每超1000千克罚款500元，最高不得超过30000元。
二、处罚程序
以江苏省为例，其“一超四罚”实施细则明确了具体的处罚程序：
信息采集与录入：
- 交通运输综合执法机构在联合执法或日常检查中，发现货运车辆超载的，会进行检测并记录相关信息，包括车牌号、车型、车辆所属企业、道路运输证号、驾驶人信息、货物装载配载单位信息等。
- 结案后3个工作日内，将上述信息录入江苏省交通运输综合行政执法管理系统。
信息分发与审核：
- 省交通运输综合执法机构将违法超限超载信息分发给相关设区的市、县（市、区）交通运输综合执法机构。
- 收到分发信息的机构在3个工作日内完成审核，并作出是否接收信息的决定。
立案调查与处罚：
- 收到分发信息的交通运输综合执法机构根据违法超限超载信息，提醒相关企业采取措施防范风险。
- 对具备依法实施“一超四罚”情形的，及时启动立案调查程序。
- 根据调查结果，依法作出吊销道路运输证、责令货运车辆驾驶人停止从事营业性运输、责令道路运输企业停业整顿、吊销道路运输经营许可证等处罚决定。
听证与告知：
- 作出吊销道路运输证、责令货运车辆驾驶人停止从事营业性运输、责令道路运输企业停业整顿、吊销道路运输经营许可证、较大数额罚款等行政处罚决定前，告知当事人有要求听证的权利。
执行与监督：
- 交通运输综合执法机构负责执行处罚决定，并监督被处罚对象履行处罚义务。
- 对停业整顿的道路运输企业，交通运输综合执法机构可以进行抽查，确保其停业整顿期间不得关闭所属营运车辆的动态监控系统。
三、特别说明
- “一超四罚”是指对货运车辆超限超载行为，同时处罚货运车辆、货运车辆驾驶人、道路运输企业以及货物装载源头单位。
- 处罚程序可能因地区而异，但基本遵循信息采集、分发审核、立案调查、处罚执行等步骤。
综上所述，交通运输部门对超载的处罚程序是一个严谨而细致的过程，旨在确保道路交通安全和运输秩序。如果您或您的企业遇到超载处罚问题，建议积极配合交通运输部门的调查和处理，并依法维护自身权益。