因工程承包人原因擅自停工，承包人需承担违约责任，其中可能包括支付违约金。以下从不同角度对此问题进行分析：

一、违约责任的认定

根据《民法典》的相关规定，因总承包方（即工程承包人）原因导致工程停工的，应由总承包方承担违约责任。违约责任的形式多样，包括但不限于：

1. 赔偿损失：承包人需赔偿因停工给发包人（即业主）造成的实际损失，如工期延误导致的额外费用、利润损失等。
2. 支付违约金：若合同中明确约定了违约金条款，且停工行为构成违约，则承包人需按照约定支付违约金。违约金的数额通常根据合同约定或实际损失情况确定。
3. 采取补救措施：承包人应采取合理措施减少损失，如尽快复工、调整施工计划等。
4. 继续履行：在可能的情况下，承包人应继续履行合同义务，完成工程建设。

二、违约金的计算与支付

1. 合同约定：若合同中明确约定了违约金的计算方式和数额，则按照合同约定执行。例如，合同可能规定“因承包人原因导致工程停工超过一定期限的，每日按合同总价款的万分之五支付违约金”。
2. 实际损失：若合同未约定违约金或约定不明确，则可根据实际损失情况确定违约金数额。实际损失包括直接损失（如额外费用）和间接损失（如利润损失）。
3. 调整机制：在司法实践中，法院可能根据公平原则和诚实信用原则，对过高的违约金进行调整，以确保违约金的合理性。

三、法律建议与后续行动

1. 审查合同：发包人应首先审查合同条款，明确违约责任和违约金的具体约定。
2. 收集证据：发包人应收集停工事实、损失情况等相关证据，以便在后续争议解决中证明自己的主张。
3. 协商解决：在可能的情况下，发包人可与承包人协商解决争议，如调整工期、减免部分费用等。
4. 法律途径：若协商无果，发包人可通过诉讼或仲裁等法律途径解决争议，要求承包人承担违约责任并支付违约金。

四、可能的法律后果

1. 承包人承担违约责任：如前所述，承包人需承担赔偿损失、支付违约金等违约责任。
2. 影响承包人信誉：擅自停工行为可能影响承包人的商业信誉和行业地位，对其未来承接工程造成不利影响。
3. 法律制裁：在严重情况下，承包人可能面临行政处罚或刑事责任（如构成犯罪时）。

总结与建议：因工程承包人原因擅自停工的，承包人需承担违约责任，其中可能包括支付违约金。发包人应审查合同条款、收集证据，并视情况与承包人协商解决或通过法律途径解决争议。如有具体法律问题或需要进一步法律帮助，请直接向我咨询。