林业部（现国家林业和草原局）关于林权证作为林地权属法律凭证的回复，现行有效。具体分析如下：

一、法律依据与历史沿革

1. 1981年政策基础
   根据中共中央、国务院《关于保护森林，发展林业若干问题的决定》，明确要求对权属清晰的森林、林木和林地，由县级以上人民政府颁发林权证，保障所有权不变。这一政策奠定了林权证作为权属凭证的法律基础。

2. 1985年《森林法》明确规定
   《森林法》第三条第二款规定：“全民所有的和集体所有的森林、林木和林地，个人所有的林木和使用的林地，由县级以上人民政府登记造册，核发证书，确认所有权或使用权。”
   法律效果：林权证成为确认林地权属的法定凭证，具有强制执行力。

3. 1987年《土地管理法》强化确认
   《土地管理法》第九条第三款再次强调：“确认林地的所有权和使用权依照《森林法》的有关规定办理。”
   法律效果：林权证的效力通过土地管理法律体系得到进一步巩固。

二、林业部1989年回复的核心内容

林业部在《关于林权证是否作为林地权属法律凭证的请示》中明确：

1. 林权证的法律地位：不仅是林木权属凭证，更是林地权属的有效法律凭证。
   
2. 权属稳定原则：要求各地稳定山林权属，防止因权属变动引发乱砍滥伐。
   
3. 历史政策衔接：对1981年林业“三定”工作中已发放的林权证，予以承认并保障其效力。

结论：该回复内容与现行《森林法》《土地管理法》一致，未被后续法律修订否定，因此现行有效。

三、现行法律框架下的林权证效力

1. 《森林法》的持续适用
   现行《森林法》（2019年修订）第十七条延续了权属确认制度，规定：“不动产登记机构应当依法将森林、林木和林地的权属、位置、面积等信息记载于不动产登记簿。”
   法律效果：林权证作为权属凭证的功能，由不动产登记制度承接，效力未受影响。

2. 国家林业局2012年复函的印证
   国家林业局在《关于外籍人士及其组织申请采伐林木问题的复函》中明确：“林权证是林地、林木权属的法律凭证。”
   法律效果：进一步确认了林权证在涉外林木处置中的核心地位。

四、实务建议

1. 权属争议处理

   • 若林权证记载与实际权属不符，需通过行政确权程序解决，依据《森林法》第二十二条由县级以上人民政府处理。
     
   • 争议期间，任何一方不得擅自处置林木或林地。

2. 历史林权证效力

   • 1981年后颁发的林权证，若未被依法撤销或变更，仍具有法律效力。
     
   • 对“四固定”时期或土改时期确定的权属，需结合历史档案综合认定。

3. 外籍人士权属证明
   外籍人士申请采伐林木时，需提交林权证及林地租赁合同等材料，证明权属无争议。

总结：林业部关于林权证效力的回复，与现行法律体系完全契合，且未被后续法规否定，因此现行有效。若您涉及林权纠纷或需要权属确认，可携带相关材料进一步咨询，我将为您提供具体法律方案。