村庄内自然形成的公共通道被故意堵塞，责任主要在于实施堵塞行为的一方。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律责任角度
侵权责任：
- 根据《民法典》的相关规定，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。在村庄内自然形成的公共通道被故意堵塞的情况下，堵塞行为显然侵犯了其他村民的通行权，因此堵塞者应当承担相应的侵权责任。
- 侵权责任的具体形式可能包括停止侵害、排除妨碍、恢复原状等。如果堵塞行为给其他村民造成了实际损失，堵塞者还可能需要承担赔偿责任。
行政责任：
- 如果堵塞行为违反了当地政府关于村庄规划、道路管理等方面的规定，堵塞者还可能面临行政责任。例如，当地政府可能依据相关法规对堵塞者进行罚款、责令限期改正等行政处罚。
二、责任主体角度
个人责任：
- 如果堵塞行为是由某个村民个人实施的，那么该村民就是责任主体，应当承担相应的法律责任。
集体责任（如存在）：
- 在某些特殊情况下，如果堵塞行为是由村庄内的某个集体（如村民小组、村民委员会等）组织或默许的，那么该集体也可能需要承担一定的责任。但这种情况相对较少见，且需要具体证据支持。
三、实际处理建议
协商解决：
- 在发现公共通道被堵塞后，首先可以尝试与堵塞者进行协商，寻求和平解决的方式。如果堵塞者能够认识到自己的错误并主动恢复通道畅通，那么问题就可以得到迅速解决。
寻求村委或政府帮助：
- 如果协商无果，可以向村民委员会或当地政府反映情况，请求他们介入调解或处理。村民委员会和政府作为基层管理组织，有责任维护村庄内的公共秩序和公共利益。
法律途径：
- 如果堵塞行为严重侵犯了其他村民的合法权益，且协商和调解均无法解决问题，那么受害村民可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。例如，可以向法院提起民事诉讼，要求堵塞者承担侵权责任并赔偿损失。
总结与建议：村庄内自然形成的公共通道被故意堵塞时，责任主要在于实施堵塞行为的一方。在处理此类问题时，建议首先尝试协商解决；如果协商无果，可以寻求村委或政府的帮助；在必要时，还可以通过法律途径来维护自己的合法权益。如果您在处理此类问题时遇到法律难题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。