在机动车与电动自行车相撞，且电动自行车承担次要责任的情况下，检查身体的费用原则上由双方根据责任比例分担，但具体处理还需结合实际情况和保险情况。以下是我从不同角度为您进行的分析：
一、责任分担原则
根据责任比例分担：
- 在交通事故中，如果双方都有责任，那么因事故产生的费用，包括检查身体的费用，通常需要根据双方的责任比例来分担。
- 在您描述的情况下，电动自行车承担次要责任，意味着机动车将承担主要责任。因此，检查身体的费用将主要由机动车方承担，但电动自行车方也需要承担一部分。
具体比例需协商或由法院判定：
- 责任的具体比例可能因事故的具体情况而有所不同，如事故发生的地点、时间、双方的行为等。
- 如果双方无法就责任比例达成一致，可以通过协商、调解或诉讼等方式解决。在诉讼中，法院将根据事故证据和法律规定来判定双方的责任比例。
二、保险理赔情况
机动车交强险和商业险：
- 如果机动车购买了交强险和商业险，那么检查身体的费用可能由保险公司承担。
- 交强险通常会在一定限额内赔偿因交通事故造成的人身伤亡和财产损失。商业险则可能提供更全面的保障，包括医疗费用、误工费等。
电动自行车保险：
- 如果电动自行车也购买了相应的保险，如第三者责任险或意外伤害险，那么这部分费用也可能由保险公司承担。
- 但需要注意的是，电动自行车的保险覆盖范围和赔偿限额可能因保险产品和地区而有所不同。
三、实际操作建议
及时报警并保留证据：
- 在发生交通事故后，应及时报警并保留相关证据，如事故现场照片、视频、证人证言等。
- 这些证据将有助于后续的责任认定和费用分担。
与对方协商或寻求调解：
- 在责任比例明确后，可以与对方协商费用分担事宜。
- 如果协商无果，可以寻求交警部门或人民调解委员会的调解。
通过法律途径解决：
- 如果调解无果或对方拒绝承担责任，可以通过法律途径解决，如向法院提起诉讼。
- 在诉讼过程中，需要提供充分的证据来支持自己的主张。
四、特殊情况考虑
- 如果电动自行车方经济困难：
- 在某些情况下，如果电动自行车方经济困难且确实无力承担检查身体的费用，机动车方或保险公司可能会考虑给予一定的帮助或减免。
- 但这并非法律义务，而是出于人道主义或社会公德的考虑。
举例说明：假设检查身体的费用总计为1万元，且经判定机动车方承担70%的责任，电动自行车方承担30%的责任。那么，机动车方应承担7000元，电动自行车方应承担3000元。如果机动车方购买了足够的保险，这部分费用可能由保险公司承担。
最后，我建议您在处理此类事故时保持冷静和理性，及时寻求专业帮助以确保自己的权益得到保障。如果您有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。