关于电动自行车改造后出了事故保险是否赔偿的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体情况来判断。
首先，我们要明确的是，保险公司在提供保险服务时，会明确保险合同中的条款，特别是关于免责范围的部分。一般来说，如果电动自行车在改造过程中发生了保险事故，或者改造后的车辆性能、结构发生了明显变化，且这种变化导致了车辆危险程度的显著增加，而车主又未能及时向保险公司进行告知，那么在这些情况下，保险公司很可能会拒绝进行赔偿。
具体来说，有两种情形是保险公司通常不予赔付的：
车辆在改装期间发生保险事故：如果电动自行车在改造过程中，比如更换电池、电机或进行其他结构性改动时发生了事故，保险公司很可能会因为车辆处于非正常状态而拒绝赔付。
车辆改装、加装或改变使用性质后未及时通知保险公司：如果车主对电动自行车进行了改装、加装或改变了其使用性质（比如从非机动车改为机动车使用），但未能及时向保险公司进行告知，并且由于这些改动导致了车辆危险程度的显著增加，那么保险公司也将不会对这类情况进行赔付。
此外，根据《中华人民共和国保险法》的相关规定，保险公司在订立保险合同时，应当在投保单、保险单或者其他保险凭证上作出足以引起投保人注意的提示，并对免除保险人责任的条款以书面或者口头形式向投保人作出明确说明。如果保险公司未作提示或者明确说明，那么这些免责条款将不产生效力。但这也并不意味着车主可以随意改造车辆而不承担风险，因为一旦改造导致车辆危险程度增加，且未告知保险公司，车主仍然可能面临无法获得赔偿的风险。
因此，我建议车主在改造电动自行车前，一定要详细了解保险合同中的条款，特别是关于免责范围的部分，并与保险公司进行充分沟通，确保改造后的车辆仍然能够获得保险保障。如果确实需要进行改造，也应及时向保险公司进行告知，并按照保险公司的要求进行相应的手续办理。