员工在这种情况下确实有可能涉及违法。以下是对此问题的详细分析：
违法性分析
无证经营的法律后果：
- 根据我国相关法律法规，经营烟草制品需要取得相应的烟草专卖零售许可证。未取得许可证而经营烟草制品，属于非法经营行为，可能面临行政处罚，甚至刑事处罚。
员工行为的性质：
- 员工在公司要求下，为没有烟草证的店铺购买并售卖烟草制品，这一行为实际上是在协助店铺进行非法经营。尽管员工没有从中直接获利，但他们的行为仍然构成了对非法经营活动的帮助和支持。
法律责任的承担：
- 在这种情况下，员工可能因协助非法经营而承担相应的法律责任。这包括但不限于行政处罚（如罚款、没收违法所得等）和刑事处罚（如非法经营罪等）。当然，具体责任的承担还需根据员工在非法经营活动中的具体作用、情节严重程度等因素来综合判断。
可能的法律后果
行政处罚：
- 如果员工的行为被认定为协助非法经营，他们可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等。这些处罚旨在惩罚违法行为，并防止类似行为的再次发生。
刑事处罚：
- 在某些情况下，如果员工的行为情节严重，如涉及大量烟草制品的非法经营，或者存在其他恶劣情节，他们可能面临刑事处罚，如非法经营罪等。这将导致更严重的法律后果，包括有期徒刑、罚金等。
建议与措施
立即停止违法行为：
- 如果员工发现自己被卷入此类非法经营活动，应立即停止相关行为，并避免进一步参与。
积极配合调查：
- 如果相关部门对此事进行调查，员工应积极配合，如实陈述事实，提供相关证据。
寻求法律帮助：
- 如果员工担心自己的法律责任或面临法律纠纷，应及时寻求专业律师的法律帮助。律师可以提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助员工维护自己的合法权益。
如果有任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供专业的法律意见和帮助。