面包车拉学生超了3人属于超员行为，是违法的。具体违法性及处罚措施需根据车辆性质、超员程度等因素综合判定，以下从不同角度进行分析：

一、非校车拉载普通学生超员

1. 超员未达20%：

   • 罚款：依据《道路交通安全法》，处20元以上200元以下罚款。
   • 扣分：记3分。
   • 示例：若面包车核定载客7人，实际载客8人（未达20%超员），则面临上述罚款和扣分。

2. 超员20%及以上：

   • 罚款：同样依据《道路交通安全法》，处20元以上200元以下罚款（但实践中可能根据具体情况有所上调）。
   • 扣分：记6分。
   • 示例：若面包车核定载客7人，实际载客9人及以上（20%及以上超员），则面临更重的罚款和扣分。

二、面包车作为校车拉载幼儿或中小学生超员

若面包车作为校车使用，超员的处罚标准更为严格：

1. 超员未达20%：

   • 罚款：处20元以上200元以下罚款。
   • 扣分：记6分。

2. 超员20%以上未达50%：

   • 罚款：处20元以上200元以下罚款（实际处罚可能更重）。
   • 扣分：记9分。

3. 超员50%以上未达100%：

   • 罚款：处200元以上500元以下罚款。
   • 扣分：记12分。

4. 超员100%及以上：

   • 罚款：处500元以上2000元以下罚款。
   • 扣分：记12分。
   • 其他措施：公安机关交通管理部门会扣留机动车至违法状态消除。

三、非法营运的处罚

若面包车在未取得相关营运许可的情况下，以营利为目的接送学生，则视为非法营运：

• 罚款：有违法所得的，没收违法所得，并处违法所得2倍以上10倍以下的罚款；没有违法所得或者违法所得不足2万元的，处3万元以上10万元以下的罚款。
• 刑事责任：构成犯罪的，依法追究刑事责任。

四、未取得校车标牌的处罚

若面包车未取得校车标牌而提供校车服务，则：

• 罚款与扣留：公安机关交通管理部门将扣留该机动车，并处1万元以上2万元以下的罚款；有违法所得的将予以没收。
• 吊销经营许可：对于取得道路运输经营许可的企业或者个体经营者有此违法行为的，情节严重的，交通运输主管部门还将吊销其经营许可证件。

五、法律建议

1. 严格遵守载客规定：驾驶员应确保面包车不超员，特别是拉载学生时，更应严格遵守相关规定。
2. 取得合法资质：若面包车作为校车或营运车辆使用，必须取得相应的合法资质。
3. 加强安全教育：学校、家长及社会各界应加强对学生的交通安全教育，引导学生乘坐合法、安全的交通工具。

结论与提醒：面包车拉学生超员是违法的，且处罚力度与超员的严重程度成正比。为确保道路交通安全和学生的人身安全，请驾驶员严格遵守相关规定，避免超载行为的发生。如有任何法律问题，可直接向我咨询。