刑事自诉与公诉案件分别遵循不同的程序流程。以下是针对两种案件类型的详细程序说明：
一. 刑事自诉案件的程序
立案审查：
- 自诉人向人民法院提交自诉状及相关证据。
- 法院对案件进行立案审查，主要查明有无明确的被告人、有无足够的证据证明被告人犯罪、案件是否属于受诉人民法院管辖等。
- 如果符合立案条件，法院将开庭审判；如果缺乏罪证，法院将说服自诉人撤回自诉或裁定驳回。
案件审理：
- 自诉案件的一审程序与公诉案件基本相同，但有一些特殊规定。
- 对于告诉才处理的案件和被害人有证据证明的轻微刑事案件，可以适用简易程序，由审判员一人独任审判。
- 法院可以进行调解，调解达成协议后制作调解书，送达双方当事人后即发生法律效力。但对于被害人有证据证明对被告人侵犯自己人身、财产权利的行为应当依法追究刑事责任，而侦查机关或者人民检察院不予追究被告人刑事责任的案件，不适用调解。
- 在审理过程中，自诉人可以同被告人自行和解或撤回自诉。对当事人自行和解的应记录在案，对自诉人申请撤诉的一般应予准许。
- 如果自诉人经两次合法传唤，无正当理由拒不到庭或未经法庭许可中途退庭，应按撤诉处理。
二. 刑事公诉案件的程序
侦查立案：
- 侦查机关接受报案人或控告人的举报，或侦查机关自行发现犯罪线索，予以立案侦查。
移送审查起诉：
- 侦查机关侦查终结，认为犯罪嫌疑人涉嫌犯罪，向人民检察院提请公诉，提交起诉意见书，并附全案证据。
提起公诉：
- 检察院对侦查机关移送起诉的案件进行审查，对认为证据确实充分的案件，向人民法院提起公诉。对证据不充分的案件，退回补充侦查。
法庭审判：
- 人民法院受理检察院提起公诉的案件，组织控辩双方对证据进行质证、辩论，听取被告人的陈述，综合全案证据作出有罪或无罪的判决。
综上所述，刑事自诉案件与公诉案件在程序上存在显著差异。自诉案件由自诉人直接向人民法院提起，并承担举证责任；而公诉案件则由侦查机关立案侦查，通过人民检察院提起公诉，最终由人民法院进行审判。