结论前置：

1. 未办理结婚登记而共同生活，不构成法律上的婚姻关系，孩子抚养权的归属需根据具体情况判断。
2. 亲子鉴定入户男方，并不直接决定抚养权的归属，法院会综合考虑多种因素来确定。

详细分析：

首先，我们需要明确的是，如果双方并未办理结婚登记手续而共同生活，这种关系在法律上并不被认定为婚姻关系。因此，当双方决定分开时，并不涉及“离婚”这一法律程序，而是需要处理共同生活期间产生的财产分割、子女抚养等问题。

针对您提出的“孩子归谁”的问题，这主要涉及到子女的抚养权归属。在未办理结婚登记的情况下，子女的抚养权归属并不直接由亲子鉴定结果决定，而是需要法院根据子女的权益和双方的具体情况来进行综合判断。

法院在判决子女抚养权时，通常会考虑以下因素：

1. 子女的年龄和健康状况：对于年幼或健康状况不佳的子女，法院可能会更倾向于判决给能够提供更好照顾和医疗条件的一方。

2. 双方的经济能力和生活环境：法院会评估双方的经济状况、居住条件等，以判断哪一方能够为子女提供更稳定、更优越的生活环境。

3. 子女的意愿和感情依赖：如果子女已经具备一定的表达能力，法院可能会考虑其意愿和感情依赖，尽量满足子女的合理需求。

4. 双方的抚养意愿和抚养能力：法院会评估双方对子女的抚养意愿、抚养计划以及实际抚养能力，包括教育、照顾、陪伴等方面。

具体到您的案例：

• 如果男方能够证明自己具备更好的经济能力和生活环境，且子女对其有较强的感情依赖，那么法院可能会倾向于判决子女由男方抚养。
• 如果女方同样具备抚养能力，且能够证明自己与子女的关系更为亲密，或者男方存在不利于子女成长的情形（如不良嗜好、家庭暴力等），那么女方也有可能获得抚养权。

法律建议：

1. 双方应友好协商：在决定子女抚养权归属时，双方应首先尝试通过友好协商的方式解决，以减少对子女的伤害。

2. 收集证据：如果协商无果，双方应积极收集有利于自己获得抚养权的证据，如经济能力证明、居住条件证明、子女意愿表达等。

3. 寻求法律帮助：在处理此类问题时，建议双方寻求专业律师的法律帮助，以确保自己的权益得到充分保障。

可能的法律后果：

• 如果法院判决子女由一方抚养，另一方则享有探视权，并需要支付一定的抚养费。
• 如果一方不履行抚养义务或侵犯另一方的探视权，另一方可以依法向法院提起诉讼，要求对方履行义务或承担责任。

最后，需要强调的是，每个案件的具体情况都是不同的，法院在判决时会综合考虑多种因素。因此，如果您或您身边的人遇到类似的问题，建议直接向我咨询，以便获得更具体、更专业的法律建议。