掩饰隐瞒罪案件在检察院三个月未有消息，可能存在以下几种情况：
案件仍在审查起诉阶段：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，检察院审查起诉的期限通常为一个月，对于重大、复杂的案件，可以延长十五日。若案件涉及证据复杂、需要进一步核实，或者存在其他特殊情况，如不可抗力等，审查起诉的时间可能会相应延长。因此，三个月未有消息，可能意味着案件仍在审查起诉过程中，检察院正在对案件进行全面、细致的审查。
案件可能存在补充侦查的情况：
- 在审查起诉过程中，如果检察院认为案件证据不足或者存在其他需要进一步调查的情况，可能会决定将案件退回公安机关补充侦查。补充侦查的期限一般为一个月，补充侦查完毕后，公安机关会再次将案件移送检察院审查起诉。此时，审查起诉的期限会重新计算。因此，如果案件经历了补充侦查，那么三个月未有消息也是有可能的。
案件可能处于其他特殊程序或状态：
- 除了正常的审查起诉和补充侦查程序外，案件还可能因其他特殊原因而处于停滞状态。例如，检察院可能正在等待其他相关部门的调查结果或者意见，或者案件可能涉及多个犯罪嫌疑人、多个罪名，需要协调处理等。这些情况都可能导致案件在检察院长时间未有进展。
针对您的情况，我建议您采取以下措施：
保持冷静，等待通知：
- 首先，您需要保持冷静，不要过于焦虑或恐慌。刑事案件的处理需要时间，尤其是涉及复杂证据和事实的案件。您可以通过合法途径了解案件进展，但不必过分催促或干扰司法机关的工作。
依法询问案件进展：
- 作为案件当事人或者其辩护人，您有权知晓案件的审查起诉进展等相关情况。您可以通过辩护人（如果有的话）或者自己依法向检察院询问案件的进展情况。但请注意，询问时应当遵守法律规定和司法程序，不得干扰或阻碍司法机关的正常工作。
积极配合司法机关的工作：
- 如果司法机关需要您提供与案件相关的信息或者配合调查，您应当积极配合，如实提供相关信息。这有助于司法机关更全面地了解案件情况，加快案件的处理进度。
最后，我需要提醒您的是：
- 刑事案件的处理涉及复杂的法律程序和证据认定，需要专业律师的指导和协助。如果您对案件处理有任何疑问或者需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业的法律意见和帮助。