轿车在绿灯时行驶，与闯红灯的电动车相撞后不知情离开，交警扣车是否合理，需分情况讨论：
一、若轿车司机确实不知情，且无逃逸故意
扣车目的与合理性：
- 交警扣车的主要目的是为了进行事故调查，包括确定事故责任、收集证据等。
- 在此情况下，如果交警认为扣车是进行事故调查的必要手段，且扣车行为符合法定程序，那么扣车是合理的。
后续处理：
- 轿车司机应积极配合交警的调查，提供必要的证据和信息。
- 如果调查结果显示轿车司机无责任或责任较小，且扣车目的已达成，交警应及时放行车辆。
二、若轿车司机存在逃逸故意（尽管其声称不知情，但需根据证据判断）
逃逸行为的认定：
- 逃逸行为通常指事故发生后，当事人为了逃避法律责任而擅自离开现场的行为。
- 如果交警通过调查发现轿车司机存在逃逸故意（如通过监控录像、证人证言等证据），那么扣车行为不仅合理，而且轿车司机还可能面临更严重的法律责任。
法律责任：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，造成交通事故后逃逸，尚不构成犯罪的，由公安机关交通管理部门处二百元以上二千元以下罚款，并可并处十五日以下拘留。
- 如果逃逸行为导致严重后果（如人员伤亡、重大财产损失等），轿车司机还可能面临刑事责任。
扣车与后续处理：
- 在认定逃逸行为后，交警会继续扣留车辆作为证据，并依法对轿车司机进行处罚。
- 轿车司机应积极配合调查，接受处罚，并承担相应的民事赔偿责任。
三、关于事故责任与赔偿
事故责任认定：
- 事故责任应根据双方的行为和过错程度来认定。在此案例中，电动车闯红灯是导致事故的主要原因，应承担主要责任。
- 轿车司机如果无过错（如正常行驶、无超速等），则不应承担责任。但如果轿车司机存在过错（如未注意观察路况等），则可能承担部分责任。
民事赔偿责任：
- 无论事故责任如何认定，双方都应根据过错程度承担相应的民事赔偿责任。
- 电动车方应赔偿轿车方的车辆维修费用等损失；如果轿车方也存在过错，则应按过错比例分担损失。
四、建议与提醒
对于轿车司机：
- 在发生交通事故后，应立即停车、保护现场并报警处理。即使认为自身无责任或不知情，也应积极配合交警的调查。
- 如果确实不知情而离开现场，应在发现后尽快向交警报告并说明情况。
对于电动车方：
- 闯红灯是严重的交通违法行为，应严格遵守交通规则以避免类似事故的发生。
- 如果发生事故，应立即停车、保护现场并报警处理；同时积极与对方协商赔偿事宜以减少纠纷。
总之，交警扣车是否合理需根据具体情况和证据来判断。如果轿车司机确实不知情且无逃逸故意，扣车行为应是为了进行事故调查；如果存在逃逸故意，则扣车行为不仅合理而且轿车司机还可能面临更严重的法律责任。在任何情况下，双方都应积极配合交警的调查并承担相应的法律责任和民事赔偿责任。