针对您提出的“检察院做相对不起诉后，案件移交市场监督管理局做行政处罚，如何罚款”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、相对不起诉与行政处罚的关系
首先，需要明确的是，相对不起诉（也称为酌定不起诉）是人民检察院在审查起诉阶段，对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的案件，作出的不起诉决定。这一决定仅代表刑事程序的终结，并不否定行为的违法性。因此，若该行为同时违反了行政法规，且未过追责时效，行政机关仍有权依法作出行政处罚。
二、法律依据与适用条件
《刑事诉讼法》规定：
- 第177条第2款明确：“对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定”。
《行政处罚法》衔接条款：
- 第35条规定了违法行为构成犯罪时，行政处罚与刑事处罚的折抵关系。但反向解读，若未被追究刑事责任（如相对不起诉），则行政处罚不受此限制。
相关衔接规定：
- 如《人民检察院刑事诉讼规则》第373条，以及中办、国办转发的《关于加强行政执法与刑事司法衔接工作的意见》，均明确了人民检察院在作出不起诉决定后，应将案件移送有关行政执法机关处理。
三、实务操作要点
证据材料移交：
- 检察机关作出相对不起诉决定后，应将案卷材料移送行政机关。行政机关需审查证据是否满足行政处罚证明标准。
处罚种类选择：
- 行政机关在作出行政处罚时，需根据违法行为的性质、情节以及社会危害程度等因素，选择合适的处罚种类和幅度。
- 若刑事程序中已采取强制措施（如取保候审保证金），可能抵扣部分罚款金额。但需注意，避免重复处罚，例如刑事没收违法所得后，行政罚款应扣除已没收部分。
罚款数额的确定：
- 罚款数额的确定应依据相关行政法规的具体规定，并结合违法行为的实际情况进行裁量。
- 行政机关在裁量罚款数额时，应考虑行为的社会危害性是否降低（如已退赔损失）、是否配合调查（如主动消除影响）以及与类似案件的处罚均衡性等因素。
四、典型案例参考
以虚开发票案为例，某企业因虚开普通发票被移送起诉，检察院认为情节轻微不起诉。随后，税务机关依据《税收征收管理法》对该企业处以罚款并加收滞纳金。这一案例表明，即使获得不起诉决定，企业仍可能面临行政处罚。
五、风险防范建议
对当事人：
- 即使获得不起诉决定，仍需关注行政机关后续动作，及时了解并配合行政处罚程序。
- 可通过听证、陈述申辩等方式争取从轻处理。
对执法机关：
- 建立“刑行衔接”信息共享平台，确保案件移送和处罚的及时性和有效性。
- 定期清理长期悬而未决的案件，防止超期处罚和遗漏处罚。
总结：相对不起诉并非“免罚金牌”，而是将行为评价回归行政法律框架。在实务操作中，行政机关需根据违法行为的实际情况和相关行政法规的规定，合理确定罚款数额和处罚种类。同时，当事人也应积极配合行政处罚程序，争取从轻处理。