建筑工程下游请款开票一般不包含罚款，但具体是否包含需结合合同约定、罚款性质及开票规范综合判断，以下分情况说明：

1. 合同明确约定罚款可纳入请款范围

若双方签订的建筑工程合同中明确约定：下游分包方/供应商因违约需支付的罚款，可由上游总包方/发包方从应付款中扣除，且扣除的罚款金额可纳入开票范围（例如合同约定“罚款作为违约金处理，计入工程款结算并开具发票”），则此时请款开票可能包含罚款。
但需注意：此类约定需符合《民法典》中关于违约金调整的规定（若罚款过高，违约方可请求法院或仲裁机构减少），且开票内容需与实际业务一致（如罚款性质为“违约金”或“赔偿款”，需在发票备注栏或项目栏中明确）。

2. 合同未约定或罚款性质为行政处罚

若合同未明确约定罚款可纳入请款范围，或罚款属于行政机关（如住建部门）对违规行为的行政处罚（例如因安全施工不达标被罚款），则罚款不应纳入请款开票范围。原因如下：

• 行政处罚的独立性：行政罚款是行政机关对违法行为的制裁，与民事合同中的工程款结算无关，上游方无权将行政罚款转嫁给下游方，更无权要求下游方开具发票。
  
• 开票合规性：根据《发票管理办法》，发票需真实反映交易内容。若将行政罚款包装为“工程款”或“服务费”开票，可能涉嫌虚开发票（如无实际交易背景），面临税务处罚。

3. 实务中的操作风险

即使合同约定罚款可纳入请款开票，也需谨慎操作：

• 税务合规：罚款若以“违约金”名义开票，需确保符合增值税“价外费用”的规定（即与主营业务直接相关）。若罚款与工程款无直接关联（如因延迟交货的罚款），可能不被认定为价外费用，无法开具工程类发票。
  
• 证据留存：需保留合同、罚款通知、付款凭证等证据，证明罚款的合法性及与请款的关联性，避免后续纠纷。

建议：

1. 审查合同条款，明确罚款的承担方及是否可纳入结算；
   
2. 若涉及行政罚款，建议单独处理（如下游方直接缴纳至行政机关），避免混入工程款；
   
3. 开票时严格按实际业务内容填写，必要时咨询税务机关。
   

如有具体合同或案例，可进一步提供细节，我会为您分析合规性及风险点。