经济补偿协议通常是一式两份，即雇佣方与员工双方各自持有一份。这种做法的主要目的在于确保双方的合法权益得到有效保障。

法律依据与目的

从法律层面而言，签署两份协议能够确保当事双方各自持有相同内容的协议文本，这如同各自的法律依据，用于保护自身利益。在协议履行过程中，如果未来出现任何纷争或纠纷，双方都可以依据手中所持有的协议文档，主张并维护自身的各项权益，同时认真履行各自应当承担的责任和义务。

特殊情况下的份数增加

虽然经济补偿协议通常是一式两份，但在某些非常特殊的情况下，有可能还需根据实际工作需求进一步增订份数。例如，如果协议需要提交给劳动监察部门进行备案，或者供其他相关部门进行审查，那么可能需要增加协议的份数。这种情况下，增加份数是为了满足行政管理和法律监管的需要。

协议份数的灵活性

值得注意的是，协议的份数并没有严格的法律规定必须是一式两份。在某些情况下，如果合同当事人有几人，那么合同文本至少就得有几份，以确保每个当事人都能持有一份。例如，如果协议涉及多方主体，如雇佣方、员工以及第三方机构，那么可能需要一式三份或更多份数的协议。然而，在大多数情况下，经济补偿协议仍然是一式两份，以满足雇佣方和员工双方的基本需求。

实际操作建议

在实际操作中，我建议雇佣方和员工在签署经济补偿协议时，务必确保协议的内容完整、准确，并且双方各自持有一份协议文本。这样不仅可以保障双方的合法权益，还可以在出现纠纷时提供有力的法律证据。同时，如果协议需要提交给相关部门进行备案或审查，那么应根据实际需求增加协议的份数。

如果您在经济补偿协议方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，提供详细、专业的法律建议。