申请执行有期限限制，但这个期限并非诉讼时效，而是申请执行时效，一般为二年。以下是对这一问题的详细解答：
一、申请执行时效的基本规定
时效期间：根据《民事诉讼法》的相关规定，申请执行的期间为二年。这个期间从法律文书规定履行期间的最后一日起计算；如果法律文书规定分期履行，那么从规定的每次履行期间的最后一日起计算；如果法律文书未规定履行期间，则从法律文书生效之日起计算。
时效中止：在申请执行时效期间的最后六个月内，如果因为不可抗力或者其他障碍不能行使请求权，申请执行时效会中止。从中止时效的原因消除之日起，申请执行时效期间会继续计算。
时效中断：如果权利人向义务人提出履行请求，或者义务人同意履行义务，或者权利人提起诉讼、申请仲裁等，都会导致申请执行时效中断。从中断时起，申请执行时效期间会重新计算。
二、申请执行时效与诉讼时效的区别
定义不同：诉讼时效是指权利人在法定期间内不行使权利，即丧失请求法院依法保护其民事权利的权利的制度。而申请执行时效则是指权利人在法律文书生效后，向法院申请强制执行的期限。
期间长度不同：一般来说，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年（《民法典》规定），而申请执行的期间为二年。
起算点不同：诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。而申请执行时效期间则从法律文书规定履行期间的最后一日起计算，或者从法律文书生效之日起计算（如果法律文书未规定履行期间）。
三、超过申请执行时效的后果
如果超过申请执行时效期间向法院申请强制执行，法院仍然会受理。但是，如果被执行人对申请执行时效期间提出异议，并且经法院审查异议成立的，法院会裁定不予执行。这意味着，权利人可能会因为超过申请执行时效而失去通过法院强制执行来维护自己权益的机会。
四、建议与注意事项
及时行使权利：权利人应当在法律文书生效后，及时向法院申请强制执行，以免因为超过申请执行时效而失去维护自己权益的机会。
注意时效中止与中断：在申请执行过程中，如果遇到不可抗力或者其他障碍导致无法行使请求权，应当及时向法院申请时效中止。同时，如果权利人向义务人提出履行请求等情形导致时效中断，也应当及时保留相关证据。
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总结来看，申请执行有期限限制，但这个期限是申请执行时效而非诉讼时效。权利人应当在法律规定的期限内及时向法院申请强制执行，以免因为超过时效而失去维护自己权益的机会。