在企业查案过程中，若本人拒不配合，可能会面临一系列法律后果和应对措施，具体如下：
一、法律后果
行政处罚：
- 根据《企业信息公示暂行条例》第十五条，工商行政管理部门对企业公示的信息依法开展抽查或者根据举报进行核查时，企业应当配合，接受询问调查，如实反映情况，提供相关材料。若企业不予配合且情节严重，工商行政管理部门有权通过企业信用信息公示系统公示其行为，并可能处以相应罚款。
- 对于税务、环保等部门的抽查，若企业拒不配合，同样会面临相应的行政处罚，如罚款、警告等，这些处罚会通过企业信用信息公示系统公示，影响企业信誉。
法律责任：
- 若当事人故意拒不出席调查、拒绝提供相关证据或信息等，可能会面临更严重的法律责任，如拘留等。在极端情况下，若拒不配合行为构成犯罪，如妨害公务罪，还可能面临刑事处罚。
二、应对措施
执法部门措施：
- 发出协助调查通知、传唤：相关执法部门有权依据法律规定，向拒不配合的当事人发出协助调查通知或进行传唤，要求其配合调查。
- 固定留存证据：执法人员在遇到拒不配合的情况时，应注意固定留存证据，如采取执法全过程记录，确保调查过程的合法性和有效性。
- 联系公安部门介入：在必要时，执法部门可以联系公安部门介入处理，以强制当事人配合调查。
- 制发《限期提供证据通知书》：对于找各种借口不来接受调查的当事人，执法部门可以向其制发《限期提供证据通知书》，要求其在规定期限内提供相关证据。到期未提供且经多次催告拒不提供的，执法部门可采取进一步法律手段。
企业应对建议：
- 积极配合调查：企业应认识到配合调查的重要性，积极响应执法部门的调查要求，如实提供相关资料和信息。
- 加强内部管理：企业应建立健全内部管理制度，确保员工了解并遵守相关法律法规，避免因个人行为导致企业面临法律风险。
- 寻求法律帮助：若企业在调查过程中遇到法律问题或困惑，应及时寻求专业律师的帮助，以确保企业的合法权益得到保障。
三、实际案例参考
- 某企业因拒绝接受市场监督管理部门的抽查，并在监管人员要求提供相关资料时弄虚作假，被监管部门责令改正并给予警告。但该企业仍不配合，最终监管部门通过企业信用信息公示系统公示了其行为，并处以相应罚款。这一案例警示企业，拒不配合调查将面临严重的法律后果和信誉损失。
企业在面对查案时，应积极配合执法部门的调查要求，如实提供相关资料和信息。若拒不配合，将可能面临行政处罚、法律责任以及信誉损失等严重后果。因此，建议企业加强内部管理，确保员工遵守相关法律法规，并在遇到法律问题时及时寻求专业律师的帮助。如有任何法律疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。