结论：营业执照上登记有两人，现在其中一人同意取消另一人的登记，这个过程是否简单，取决于多种因素，包括公司章程的规定、双方是否达成一致以及是否符合相关法律法规的要求。
一、公司章程的规定
首先，需要查看公司章程中关于股东或合伙人退出、变更登记的相关规定。如果公司章程中明确规定了股东或合伙人退出的程序和条件，那么双方应当按照公司章程的规定来操作。如果公司章程中没有相关规定，或者规定不明确，那么就需要参考《公司法》等相关法律法规。
二、双方是否达成一致
如果双方已经达成一致：即一方同意另一方退出，并且双方已经就退出后的相关事宜（如股权转让、债务承担等）达成了协议，那么这个过程相对简单。双方可以签订一份股权转让协议或退出协议，明确双方的权利和义务，然后按照协议的规定去办理相关的变更登记手续。
如果双方未能达成一致：即一方希望退出，但另一方不同意，或者双方在退出后的相关事宜上存在分歧，那么这个过程就会相对复杂。在这种情况下，可能需要通过协商、调解或者诉讼等方式来解决争议。
三、是否符合相关法律法规的要求
在办理营业执照变更登记时，还需要确保符合相关法律法规的要求。例如，根据《公司法》的规定，股东转让股权应当遵循法定程序，包括签订股权转让协议、修改公司章程、办理工商变更登记等。如果违反了这些规定，可能会导致变更登记无效或者面临其他法律后果。
四、具体操作流程
如果双方已经达成一致，并且符合相关法律法规的要求，那么可以按照以下流程来办理营业执照的变更登记：
签订股权转让协议或退出协议：明确双方的权利和义务，包括股权转让的价格、方式、时间等。
修改公司章程：如果股权转让导致了公司章程的修改，那么需要召开股东会或者董事会来审议并通过修改后的公司章程。
办理工商变更登记：携带相关材料（如股权转让协议、修改后的公司章程、股东会或董事会决议等）到工商行政管理部门办理变更登记手续。
五、可能面临的法律后果
如果在办理营业执照变更登记的过程中违反了相关法律法规的规定，可能会面临以下法律后果：
变更登记无效：如果变更登记的程序或者内容违反了法律法规的规定，那么工商行政管理部门可能会宣告变更登记无效。
面临行政处罚：如果违反了工商行政管理方面的法律法规，可能会面临罚款、没收违法所得等行政处罚。
承担民事责任：如果因为变更登记的问题导致了其他股东或者债权人的损失，那么可能需要承担相应的民事责任。
建议：在办理营业执照变更登记的过程中，建议双方充分沟通、协商，确保符合相关法律法规的要求，并咨询专业律师的意见，以避免不必要的法律风险和纠纷。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询。