行政协议自《中华人民共和国行政诉讼法》修订并明确相关条款后，即被纳入行政诉讼范围。具体来说，这一纳入过程主要体现在以下几个方面：
一、法律依据的明确
《中华人民共和国行政诉讼法》的修订：
- 2014年修订的《中华人民共和国行政诉讼法》第十二条明确将“认为行政机关不依法履行、未按照约定履行或者违法变更、解除政府特许经营协议、土地房屋征收补偿协议等协议的”情形纳入行政诉讼的受案范围。这一修订为行政协议的可诉性提供了直接的法律依据。
相关司法解释的出台：
- 《最高人民法院关于审理行政协议案件若干问题的规定》进一步细化了行政协议案件的审理规则，包括起诉期限、管辖法院、法律适用等方面，为行政协议的可诉性提供了更为具体的操作指南。
二、行政协议纳入行政诉讼范围的具体表现
政府特许经营协议：
- 如污水处理、垃圾处理等领域的特许经营项目协议，这些协议涉及公共服务的提供和公共资源的利用，其合法性和履行情况受到法律的严格监督。当公民、法人或其他组织认为行政机关在特许经营协议中的行为侵犯其合法权益时，有权提起行政诉讼。
土地、房屋征收征用补偿协议：
- 在土地征收、房屋拆迁过程中，与行政机关签订的补偿协议是保障被征收人合法权益的重要手段。若行政机关未按照协议约定履行补偿义务，被征收人有权提起诉讼，要求行政机关履行补偿责任或赔偿损失。
其他类型的行政协议：
- 包括矿业权等国有自然资源使用权出让协议、政府投资的保障性住房租赁、买卖协议以及符合法律规定的政府与社会资本合作协议（PPP）等。这些协议同样具有可诉性，当行政机关存在违法行为或未按照协议履行义务时，相对人可通过行政诉讼寻求救济。
三、行政协议纳入行政诉讼范围的意义
保障相对人合法权益：
- 通过行政诉讼途径解决行政协议争议，有助于维护相对人的合法权益，防止行政机关滥用职权或违约行为对相对人造成损害。
促进依法行政：
- 行政协议的可诉性促使行政机关在行使职权时更加谨慎和规范，遵循法定程序和合同约定，提高依法行政水平。
推动法治政府建设：
- 行政协议作为现代行政管理的重要方式之一，其可诉性体现了法治政府建设的要求，有助于构建诚信政府、责任政府和服务型政府。
四、实际案例与操作建议
实际案例：
- 在实践中，已经有许多因行政协议引发的行政诉讼案件。例如，某市政府与一家企业签订了特许经营协议，但后来市政府未经合法程序单方面变更了协议内容。该企业认为市政府的变更行为违法，遂向人民法院提起行政诉讼。法院经审理后认为，市政府的变更行为缺乏法律依据，判决其恢复原协议内容或赔偿企业损失。
操作建议：
- 当您认为行政机关在行政协议中的行为侵犯您的合法权益时，应及时向人民法院提起行政诉讼。在提起诉讼前，建议您先收集相关证据材料，如协议文本、履行情况记录、沟通记录等。同时，注意起诉期限的规定，避免因超过期限而丧失诉讼权利。
如有任何关于行政协议或行政诉讼的疑问，欢迎直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供更为详细和专业的法律建议。